Protein–RNA interactions for Protein: O95696

BRD1, Bromodomain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD1O95696 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRD1O95696 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRD1O95696 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRD1O95696 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRD1O95696 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRD1O95696 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRD1O95696 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRD1O95696 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRD1O95696 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRD1O95696 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRD1O95696 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRD1O95696 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRD1O95696 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRD1O95696 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRD1O95696 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRD1O95696 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRD1O95696 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRD1O95696 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRD1O95696 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRD1O95696 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRD1O95696 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRD1O95696 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRD1O95696 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BRD1O95696 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
BRD1O95696 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BRD1O95696 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BRD1O95696 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BRD1O95696 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BRD1O95696 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BRD1O95696 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BRD1O95696 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BRD1O95696 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BRD1O95696 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BRD1O95696 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BRD1O95696 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BRD1O95696 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BRD1O95696 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BRD1O95696 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BRD1O95696 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRD1O95696 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRD1O95696 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRD1O95696 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRD1O95696 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRD1O95696 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRD1O95696 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
BRD1O95696 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRD1O95696 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRD1O95696 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRD1O95696 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRD1O95696 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRD1O95696 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRD1O95696 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRD1O95696 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRD1O95696 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRD1O95696 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRD1O95696 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRD1O95696 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRD1O95696 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRD1O95696 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRD1O95696 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
BRD1O95696 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRD1O95696 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRD1O95696 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRD1O95696 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRD1O95696 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRD1O95696 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRD1O95696 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRD1O95696 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRD1O95696 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRD1O95696 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRD1O95696 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRD1O95696 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRD1O95696 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRD1O95696 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRD1O95696 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRD1O95696 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
BRD1O95696 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRD1O95696 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRD1O95696 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRD1O95696 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRD1O95696 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRD1O95696 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRD1O95696 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRD1O95696 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRD1O95696 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRD1O95696 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRD1O95696 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRD1O95696 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRD1O95696 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRD1O95696 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRD1O95696 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRD1O95696 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRD1O95696 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRD1O95696 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRD1O95696 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRD1O95696 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
BRD1O95696 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRD1O95696 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRD1O95696 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRD1O95696 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms