Protein–RNA interactions for Protein: O94788

ALDH1A2, Retinal dehydrogenase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH1A2O94788 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ALDH1A2O94788 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ALDH1A2O94788 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ALDH1A2O94788 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ALDH1A2O94788 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ALDH1A2O94788 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ALDH1A2O94788 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ALDH1A2O94788 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ALDH1A2O94788 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ALDH1A2O94788 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ALDH1A2O94788 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ALDH1A2O94788 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ALDH1A2O94788 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ALDH1A2O94788 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ALDH1A2O94788 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ALDH1A2O94788 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ALDH1A2O94788 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ALDH1A2O94788 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ALDH1A2O94788 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
ALDH1A2O94788 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ALDH1A2O94788 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
ALDH1A2O94788 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ALDH1A2O94788 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ALDH1A2O94788 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ALDH1A2O94788 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ALDH1A2O94788 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ALDH1A2O94788 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ALDH1A2O94788 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ALDH1A2O94788 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
ALDH1A2O94788 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ALDH1A2O94788 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ALDH1A2O94788 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ALDH1A2O94788 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ALDH1A2O94788 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ALDH1A2O94788 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ALDH1A2O94788 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ALDH1A2O94788 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ALDH1A2O94788 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ALDH1A2O94788 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ALDH1A2O94788 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ALDH1A2O94788 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ALDH1A2O94788 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ALDH1A2O94788 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ALDH1A2O94788 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ALDH1A2O94788 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ALDH1A2O94788 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ALDH1A2O94788 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ALDH1A2O94788 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ALDH1A2O94788 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ALDH1A2O94788 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ALDH1A2O94788 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ALDH1A2O94788 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ALDH1A2O94788 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ALDH1A2O94788 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ALDH1A2O94788 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ALDH1A2O94788 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ALDH1A2O94788 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ALDH1A2O94788 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ALDH1A2O94788 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ALDH1A2O94788 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ALDH1A2O94788 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ALDH1A2O94788 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ALDH1A2O94788 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ALDH1A2O94788 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ALDH1A2O94788 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ALDH1A2O94788 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ALDH1A2O94788 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ALDH1A2O94788 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALDH1A2O94788 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALDH1A2O94788 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALDH1A2O94788 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALDH1A2O94788 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALDH1A2O94788 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALDH1A2O94788 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALDH1A2O94788 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALDH1A2O94788 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALDH1A2O94788 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ALDH1A2O94788 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALDH1A2O94788 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALDH1A2O94788 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALDH1A2O94788 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALDH1A2O94788 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALDH1A2O94788 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALDH1A2O94788 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALDH1A2O94788 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALDH1A2O94788 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALDH1A2O94788 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALDH1A2O94788 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALDH1A2O94788 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALDH1A2O94788 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALDH1A2O94788 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALDH1A2O94788 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ALDH1A2O94788 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALDH1A2O94788 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALDH1A2O94788 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALDH1A2O94788 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALDH1A2O94788 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALDH1A2O94788 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALDH1A2O94788 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALDH1A2O94788 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms