Protein–RNA interactions for Protein: O60716

CTNND1, Catenin delta-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND1O60716 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTNND1O60716 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTNND1O60716 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTNND1O60716 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTNND1O60716 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTNND1O60716 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTNND1O60716 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTNND1O60716 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTNND1O60716 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTNND1O60716 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTNND1O60716 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTNND1O60716 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTNND1O60716 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTNND1O60716 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CTNND1O60716 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTNND1O60716 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTNND1O60716 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTNND1O60716 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTNND1O60716 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTNND1O60716 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CTNND1O60716 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CTNND1O60716 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTNND1O60716 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTNND1O60716 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTNND1O60716 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTNND1O60716 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTNND1O60716 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTNND1O60716 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTNND1O60716 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTNND1O60716 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTNND1O60716 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CTNND1O60716 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CTNND1O60716 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTNND1O60716 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTNND1O60716 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTNND1O60716 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTNND1O60716 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTNND1O60716 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTNND1O60716 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTNND1O60716 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTNND1O60716 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTNND1O60716 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CTNND1O60716 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTNND1O60716 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTNND1O60716 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTNND1O60716 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTNND1O60716 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTNND1O60716 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTNND1O60716 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTNND1O60716 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTNND1O60716 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTNND1O60716 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTNND1O60716 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTNND1O60716 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTNND1O60716 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTNND1O60716 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTNND1O60716 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTNND1O60716 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTNND1O60716 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTNND1O60716 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTNND1O60716 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTNND1O60716 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTNND1O60716 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CTNND1O60716 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTNND1O60716 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTNND1O60716 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTNND1O60716 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CTNND1O60716 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTNND1O60716 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTNND1O60716 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTNND1O60716 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTNND1O60716 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTNND1O60716 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTNND1O60716 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTNND1O60716 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTNND1O60716 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTNND1O60716 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTNND1O60716 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTNND1O60716 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTNND1O60716 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTNND1O60716 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CTNND1O60716 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CTNND1O60716 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTNND1O60716 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTNND1O60716 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTNND1O60716 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTNND1O60716 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTNND1O60716 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTNND1O60716 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTNND1O60716 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTNND1O60716 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTNND1O60716 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTNND1O60716 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTNND1O60716 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTNND1O60716 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTNND1O60716 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTNND1O60716 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTNND1O60716 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTNND1O60716 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTNND1O60716 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms