Protein–RNA interactions for Protein: O60337

MARCH6, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH6, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH6O60337 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MARCH6O60337 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MARCH6O60337 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MARCH6O60337 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MARCH6O60337 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MARCH6O60337 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MARCH6O60337 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MARCH6O60337 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MARCH6O60337 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MARCH6O60337 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MARCH6O60337 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MARCH6O60337 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MARCH6O60337 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MARCH6O60337 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MARCH6O60337 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MARCH6O60337 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MARCH6O60337 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MARCH6O60337 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MARCH6O60337 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MARCH6O60337 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MARCH6O60337 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MARCH6O60337 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MARCH6O60337 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MARCH6O60337 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MARCH6O60337 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MARCH6O60337 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MARCH6O60337 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MARCH6O60337 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MARCH6O60337 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MARCH6O60337 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MARCH6O60337 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MARCH6O60337 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MARCH6O60337 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MARCH6O60337 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MARCH6O60337 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MARCH6O60337 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms