Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CREB3O43889 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CREB3O43889 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CREB3O43889 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CREB3O43889 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CREB3O43889 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CREB3O43889 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CREB3O43889 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CREB3O43889 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CREB3O43889 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CREB3O43889 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CREB3O43889 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CREB3O43889 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CREB3O43889 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CREB3O43889 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CREB3O43889 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CREB3O43889 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CREB3O43889 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CREB3O43889 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CREB3O43889 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CREB3O43889 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CREB3O43889 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CREB3O43889 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CREB3O43889 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CREB3O43889 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CREB3O43889 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CREB3O43889 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CREB3O43889 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CREB3O43889 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CREB3O43889 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CREB3O43889 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CREB3O43889 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CREB3O43889 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CREB3O43889 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CREB3O43889 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CREB3O43889 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CREB3O43889 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CREB3O43889 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CREB3O43889 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CREB3O43889 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CREB3O43889 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CREB3O43889 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CREB3O43889 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CREB3O43889 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CREB3O43889 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CREB3O43889 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CREB3O43889 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CREB3O43889 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CREB3O43889 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CREB3O43889 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CREB3O43889 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CREB3O43889 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CREB3O43889 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CREB3O43889 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CREB3O43889 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CREB3O43889 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CREB3O43889 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CREB3O43889 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CREB3O43889 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CREB3O43889 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CREB3O43889 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CREB3O43889 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CREB3O43889 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CREB3O43889 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CREB3O43889 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CREB3O43889 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CREB3O43889 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CREB3O43889 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CREB3O43889 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CREB3O43889 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CREB3O43889 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CREB3O43889 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CREB3O43889 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CREB3O43889 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CREB3O43889 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CREB3O43889 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CREB3O43889 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CREB3O43889 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CREB3O43889 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CREB3O43889 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CREB3O43889 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CREB3O43889 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CREB3O43889 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CREB3O43889 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CREB3O43889 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CREB3O43889 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CREB3O43889 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CREB3O43889 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CREB3O43889 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CREB3O43889 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CREB3O43889 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CREB3O43889 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CREB3O43889 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CREB3O43889 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CREB3O43889 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CREB3O43889 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CREB3O43889 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CREB3O43889 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CREB3O43889 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CREB3O43889 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms