Protein–RNA interactions for Protein: O43739

CYTH3, Cytohesin-3, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH3O43739 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CYTH3O43739 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CYTH3O43739 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CYTH3O43739 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYTH3O43739 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYTH3O43739 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYTH3O43739 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYTH3O43739 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYTH3O43739 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYTH3O43739 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYTH3O43739 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYTH3O43739 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYTH3O43739 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYTH3O43739 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CYTH3O43739 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYTH3O43739 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYTH3O43739 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYTH3O43739 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CYTH3O43739 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYTH3O43739 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CYTH3O43739 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYTH3O43739 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYTH3O43739 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYTH3O43739 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYTH3O43739 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYTH3O43739 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYTH3O43739 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYTH3O43739 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYTH3O43739 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYTH3O43739 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CYTH3O43739 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYTH3O43739 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYTH3O43739 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYTH3O43739 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYTH3O43739 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYTH3O43739 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYTH3O43739 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYTH3O43739 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYTH3O43739 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYTH3O43739 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYTH3O43739 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYTH3O43739 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYTH3O43739 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYTH3O43739 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYTH3O43739 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYTH3O43739 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CYTH3O43739 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CYTH3O43739 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYTH3O43739 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYTH3O43739 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYTH3O43739 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYTH3O43739 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CYTH3O43739 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYTH3O43739 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CYTH3O43739 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYTH3O43739 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYTH3O43739 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYTH3O43739 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYTH3O43739 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYTH3O43739 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYTH3O43739 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYTH3O43739 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYTH3O43739 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYTH3O43739 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYTH3O43739 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYTH3O43739 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYTH3O43739 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYTH3O43739 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYTH3O43739 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYTH3O43739 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYTH3O43739 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CYTH3O43739 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYTH3O43739 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYTH3O43739 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYTH3O43739 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYTH3O43739 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYTH3O43739 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYTH3O43739 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYTH3O43739 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYTH3O43739 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYTH3O43739 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYTH3O43739 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYTH3O43739 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYTH3O43739 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYTH3O43739 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYTH3O43739 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYTH3O43739 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYTH3O43739 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYTH3O43739 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CYTH3O43739 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CYTH3O43739 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CYTH3O43739 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CYTH3O43739 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CYTH3O43739 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CYTH3O43739 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CYTH3O43739 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CYTH3O43739 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CYTH3O43739 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CYTH3O43739 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CYTH3O43739 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms