Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA3O43365 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms