Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
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