Protein–RNA interactions for Protein: O43255

SIAH2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIAH2O43255 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SIAH2O43255 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SIAH2O43255 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SIAH2O43255 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SIAH2O43255 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SIAH2O43255 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SIAH2O43255 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SIAH2O43255 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SIAH2O43255 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SIAH2O43255 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SIAH2O43255 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIAH2O43255 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIAH2O43255 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIAH2O43255 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIAH2O43255 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIAH2O43255 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIAH2O43255 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIAH2O43255 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIAH2O43255 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIAH2O43255 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIAH2O43255 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIAH2O43255 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIAH2O43255 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIAH2O43255 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIAH2O43255 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIAH2O43255 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIAH2O43255 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIAH2O43255 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIAH2O43255 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIAH2O43255 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIAH2O43255 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIAH2O43255 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIAH2O43255 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIAH2O43255 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIAH2O43255 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIAH2O43255 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIAH2O43255 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIAH2O43255 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIAH2O43255 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SIAH2O43255 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SIAH2O43255 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SIAH2O43255 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SIAH2O43255 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SIAH2O43255 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SIAH2O43255 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SIAH2O43255 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SIAH2O43255 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SIAH2O43255 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SIAH2O43255 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SIAH2O43255 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SIAH2O43255 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SIAH2O43255 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SIAH2O43255 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SIAH2O43255 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SIAH2O43255 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SIAH2O43255 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SIAH2O43255 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SIAH2O43255 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SIAH2O43255 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SIAH2O43255 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SIAH2O43255 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SIAH2O43255 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SIAH2O43255 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SIAH2O43255 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SIAH2O43255 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SIAH2O43255 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SIAH2O43255 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SIAH2O43255 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SIAH2O43255 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SIAH2O43255 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SIAH2O43255 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SIAH2O43255 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SIAH2O43255 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SIAH2O43255 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SIAH2O43255 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SIAH2O43255 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIAH2O43255 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIAH2O43255 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIAH2O43255 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIAH2O43255 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIAH2O43255 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIAH2O43255 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIAH2O43255 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIAH2O43255 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIAH2O43255 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIAH2O43255 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIAH2O43255 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIAH2O43255 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SIAH2O43255 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIAH2O43255 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIAH2O43255 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIAH2O43255 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIAH2O43255 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIAH2O43255 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIAH2O43255 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIAH2O43255 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIAH2O43255 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIAH2O43255 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIAH2O43255 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIAH2O43255 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms