Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms