Protein–RNA interactions for Protein: O15056

SYNJ2, Synaptojanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ2O15056 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SYNJ2O15056 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SYNJ2O15056 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
SYNJ2O15056 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
SYNJ2O15056 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC33.7■■■□□ 2.99
SYNJ2O15056 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC33.7■■■□□ 2.99
SYNJ2O15056 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
SYNJ2O15056 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
SYNJ2O15056 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
SYNJ2O15056 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
SYNJ2O15056 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
SYNJ2O15056 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
SYNJ2O15056 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
SYNJ2O15056 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
SYNJ2O15056 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
SYNJ2O15056 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
SYNJ2O15056 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
SYNJ2O15056 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
SYNJ2O15056 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
SYNJ2O15056 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
SYNJ2O15056 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
SYNJ2O15056 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
SYNJ2O15056 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SYNJ2O15056 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SYNJ2O15056 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
SYNJ2O15056 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC33.68■■■□□ 2.98
SYNJ2O15056 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SYNJ2O15056 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SYNJ2O15056 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
SYNJ2O15056 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
SYNJ2O15056 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
SYNJ2O15056 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SYNJ2O15056 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
SYNJ2O15056 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
SYNJ2O15056 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
SYNJ2O15056 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SYNJ2O15056 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SYNJ2O15056 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
SYNJ2O15056 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SYNJ2O15056 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
SYNJ2O15056 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC33.67■■■□□ 2.98
SYNJ2O15056 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
SYNJ2O15056 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
SYNJ2O15056 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
SYNJ2O15056 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SYNJ2O15056 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
SYNJ2O15056 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
SYNJ2O15056 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
SYNJ2O15056 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
SYNJ2O15056 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
SYNJ2O15056 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
SYNJ2O15056 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
SYNJ2O15056 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
SYNJ2O15056 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
SYNJ2O15056 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
SYNJ2O15056 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
SYNJ2O15056 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
SYNJ2O15056 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
SYNJ2O15056 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
SYNJ2O15056 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
SYNJ2O15056 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
SYNJ2O15056 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
SYNJ2O15056 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
SYNJ2O15056 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
SYNJ2O15056 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
SYNJ2O15056 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
SYNJ2O15056 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC33.65■■■□□ 2.98
SYNJ2O15056 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
SYNJ2O15056 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
SYNJ2O15056 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
SYNJ2O15056 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
SYNJ2O15056 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
SYNJ2O15056 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
SYNJ2O15056 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
SYNJ2O15056 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
SYNJ2O15056 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
SYNJ2O15056 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
SYNJ2O15056 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
SYNJ2O15056 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
SYNJ2O15056 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
SYNJ2O15056 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
SYNJ2O15056 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
SYNJ2O15056 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
SYNJ2O15056 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
SYNJ2O15056 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
SYNJ2O15056 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
SYNJ2O15056 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
SYNJ2O15056 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
SYNJ2O15056 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
SYNJ2O15056 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
SYNJ2O15056 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
SYNJ2O15056 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
SYNJ2O15056 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
SYNJ2O15056 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
SYNJ2O15056 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
SYNJ2O15056 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
SYNJ2O15056 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
SYNJ2O15056 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
SYNJ2O15056 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
SYNJ2O15056 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms