Protein–RNA interactions for Protein: O00411

POLRMT, DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLRMTO00411 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLRMTO00411 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLRMTO00411 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLRMTO00411 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
POLRMTO00411 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLRMTO00411 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLRMTO00411 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLRMTO00411 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
POLRMTO00411 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLRMTO00411 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLRMTO00411 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLRMTO00411 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLRMTO00411 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLRMTO00411 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLRMTO00411 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLRMTO00411 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLRMTO00411 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
POLRMTO00411 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLRMTO00411 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLRMTO00411 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLRMTO00411 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLRMTO00411 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
POLRMTO00411 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLRMTO00411 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLRMTO00411 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLRMTO00411 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLRMTO00411 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
POLRMTO00411 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLRMTO00411 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLRMTO00411 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLRMTO00411 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLRMTO00411 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLRMTO00411 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLRMTO00411 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLRMTO00411 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLRMTO00411 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLRMTO00411 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLRMTO00411 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLRMTO00411 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLRMTO00411 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLRMTO00411 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLRMTO00411 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLRMTO00411 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
POLRMTO00411 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
POLRMTO00411 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLRMTO00411 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLRMTO00411 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLRMTO00411 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLRMTO00411 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLRMTO00411 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLRMTO00411 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLRMTO00411 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLRMTO00411 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLRMTO00411 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLRMTO00411 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLRMTO00411 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLRMTO00411 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLRMTO00411 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLRMTO00411 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLRMTO00411 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLRMTO00411 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLRMTO00411 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLRMTO00411 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLRMTO00411 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
POLRMTO00411 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLRMTO00411 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLRMTO00411 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLRMTO00411 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLRMTO00411 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLRMTO00411 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLRMTO00411 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLRMTO00411 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLRMTO00411 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLRMTO00411 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLRMTO00411 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLRMTO00411 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLRMTO00411 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLRMTO00411 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLRMTO00411 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLRMTO00411 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLRMTO00411 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLRMTO00411 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLRMTO00411 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLRMTO00411 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
POLRMTO00411 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLRMTO00411 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLRMTO00411 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLRMTO00411 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLRMTO00411 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLRMTO00411 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLRMTO00411 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLRMTO00411 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLRMTO00411 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLRMTO00411 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
POLRMTO00411 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLRMTO00411 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLRMTO00411 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLRMTO00411 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLRMTO00411 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
POLRMTO00411 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms