Protein–RNA interactions for Protein: H7C1C5

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1C5 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H7C1C5 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
H7C1C5 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H7C1C5 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
H7C1C5 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H7C1C5 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
H7C1C5 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
H7C1C5 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H7C1C5 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H7C1C5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H7C1C5 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
H7C1C5 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
H7C1C5 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H7C1C5 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H7C1C5 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
H7C1C5 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H7C1C5 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H7C1C5 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H7C1C5 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
H7C1C5 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
H7C1C5 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
H7C1C5 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H7C1C5 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
H7C1C5 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H7C1C5 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H7C1C5 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H7C1C5 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H7C1C5 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H7C1C5 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H7C1C5 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H7C1C5 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H7C1C5 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H7C1C5 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H7C1C5 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
H7C1C5 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
H7C1C5 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H7C1C5 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
H7C1C5 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H7C1C5 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H7C1C5 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
H7C1C5 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
H7C1C5 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H7C1C5 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
H7C1C5 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H7C1C5 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H7C1C5 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
H7C1C5 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
H7C1C5 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
H7C1C5 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
H7C1C5 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H7C1C5 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
H7C1C5 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H7C1C5 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H7C1C5 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
H7C1C5 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
H7C1C5 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
H7C1C5 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H7C1C5 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H7C1C5 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
H7C1C5 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H7C1C5 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
H7C1C5 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
H7C1C5 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H7C1C5 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
H7C1C5 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
H7C1C5 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
H7C1C5 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H7C1C5 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
H7C1C5 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H7C1C5 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
H7C1C5 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H7C1C5 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H7C1C5 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H7C1C5 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
H7C1C5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
H7C1C5 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
H7C1C5 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
H7C1C5 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
H7C1C5 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H7C1C5 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
H7C1C5 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H7C1C5 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
H7C1C5 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H7C1C5 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H7C1C5 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
H7C1C5 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
H7C1C5 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
H7C1C5 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
H7C1C5 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
H7C1C5 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
H7C1C5 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
H7C1C5 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
H7C1C5 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
H7C1C5 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
H7C1C5 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
H7C1C5 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
H7C1C5 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
H7C1C5 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
H7C1C5 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
H7C1C5 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms