Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
E9PCH4 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
E9PCH4 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
E9PCH4 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
E9PCH4 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
E9PCH4 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
E9PCH4 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
E9PCH4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
E9PCH4 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
E9PCH4 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
E9PCH4 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
E9PCH4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
E9PCH4 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
E9PCH4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
E9PCH4 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
E9PCH4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
E9PCH4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
E9PCH4 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
E9PCH4 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
E9PCH4 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
E9PCH4 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
E9PCH4 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
E9PCH4 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
E9PCH4 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
E9PCH4 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
E9PCH4 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
E9PCH4 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
E9PCH4 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
E9PCH4 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
E9PCH4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
E9PCH4 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
E9PCH4 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
E9PCH4 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
E9PCH4 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
E9PCH4 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
E9PCH4 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
E9PCH4 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
E9PCH4 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
E9PCH4 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
E9PCH4 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
E9PCH4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
E9PCH4 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
E9PCH4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
E9PCH4 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
E9PCH4 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
E9PCH4 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
E9PCH4 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
E9PCH4 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
E9PCH4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
E9PCH4 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
E9PCH4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
E9PCH4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
E9PCH4 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
E9PCH4 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
E9PCH4 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
E9PCH4 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
E9PCH4 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
E9PCH4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
E9PCH4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
E9PCH4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
E9PCH4 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
E9PCH4 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
E9PCH4 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
E9PCH4 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
E9PCH4 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
E9PCH4 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
E9PCH4 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
E9PCH4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
E9PCH4 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
E9PCH4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
E9PCH4 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
E9PCH4 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
E9PCH4 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
E9PCH4 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
E9PCH4 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC29.93■■■□□ 2.38
E9PCH4 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
E9PCH4 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
E9PCH4 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
E9PCH4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
E9PCH4 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
E9PCH4 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
E9PCH4 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
E9PCH4 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
E9PCH4 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
E9PCH4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
E9PCH4 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
E9PCH4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
E9PCH4 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
E9PCH4 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
E9PCH4 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
E9PCH4 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
E9PCH4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
E9PCH4 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
E9PCH4 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
E9PCH4 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
E9PCH4 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
E9PCH4 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
E9PCH4 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
E9PCH4 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
E9PCH4 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms