Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ERVV-1B6SEH8 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ERVV-1B6SEH8 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ERVV-1B6SEH8 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ERVV-1B6SEH8 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ERVV-1B6SEH8 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ERVV-1B6SEH8 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ERVV-1B6SEH8 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ERVV-1B6SEH8 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ERVV-1B6SEH8 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ERVV-1B6SEH8 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ERVV-1B6SEH8 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ERVV-1B6SEH8 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ERVV-1B6SEH8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ERVV-1B6SEH8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ERVV-1B6SEH8 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ERVV-1B6SEH8 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ERVV-1B6SEH8 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ERVV-1B6SEH8 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ERVV-1B6SEH8 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ERVV-1B6SEH8 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ERVV-1B6SEH8 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ERVV-1B6SEH8 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ERVV-1B6SEH8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ERVV-1B6SEH8 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
ERVV-1B6SEH8 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
ERVV-1B6SEH8 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
ERVV-1B6SEH8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
ERVV-1B6SEH8 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERVV-1B6SEH8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERVV-1B6SEH8 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERVV-1B6SEH8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERVV-1B6SEH8 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERVV-1B6SEH8 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERVV-1B6SEH8 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ERVV-1B6SEH8 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERVV-1B6SEH8 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERVV-1B6SEH8 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERVV-1B6SEH8 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERVV-1B6SEH8 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERVV-1B6SEH8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERVV-1B6SEH8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERVV-1B6SEH8 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERVV-1B6SEH8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERVV-1B6SEH8 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ERVV-1B6SEH8 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ERVV-1B6SEH8 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ERVV-1B6SEH8 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ERVV-1B6SEH8 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ERVV-1B6SEH8 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ERVV-1B6SEH8 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ERVV-1B6SEH8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ERVV-1B6SEH8 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ERVV-1B6SEH8 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ERVV-1B6SEH8 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ERVV-1B6SEH8 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ERVV-1B6SEH8 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ERVV-1B6SEH8 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ERVV-1B6SEH8 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ERVV-1B6SEH8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ERVV-1B6SEH8 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ERVV-1B6SEH8 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ERVV-1B6SEH8 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ERVV-1B6SEH8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ERVV-1B6SEH8 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ERVV-1B6SEH8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERVV-1B6SEH8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERVV-1B6SEH8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERVV-1B6SEH8 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERVV-1B6SEH8 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERVV-1B6SEH8 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERVV-1B6SEH8 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERVV-1B6SEH8 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERVV-1B6SEH8 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERVV-1B6SEH8 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERVV-1B6SEH8 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERVV-1B6SEH8 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERVV-1B6SEH8 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ERVV-1B6SEH8 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERVV-1B6SEH8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERVV-1B6SEH8 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERVV-1B6SEH8 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERVV-1B6SEH8 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERVV-1B6SEH8 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERVV-1B6SEH8 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERVV-1B6SEH8 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERVV-1B6SEH8 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERVV-1B6SEH8 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERVV-1B6SEH8 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERVV-1B6SEH8 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ERVV-1B6SEH8 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ERVV-1B6SEH8 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERVV-1B6SEH8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERVV-1B6SEH8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERVV-1B6SEH8 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERVV-1B6SEH8 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERVV-1B6SEH8 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERVV-1B6SEH8 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERVV-1B6SEH8 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ERVV-1B6SEH8 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms