Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms