Protein–RNA interactions for Protein: A8MV81

HIGD1C, HIG1 domain family member 1C, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1CA8MV81 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms