Protein–RNA interactions for Protein: A6NNY8

USP27X, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP27XA6NNY8 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP27XA6NNY8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP27XA6NNY8 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP27XA6NNY8 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
USP27XA6NNY8 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP27XA6NNY8 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP27XA6NNY8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP27XA6NNY8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
USP27XA6NNY8 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP27XA6NNY8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP27XA6NNY8 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP27XA6NNY8 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP27XA6NNY8 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP27XA6NNY8 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP27XA6NNY8 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP27XA6NNY8 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP27XA6NNY8 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP27XA6NNY8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP27XA6NNY8 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP27XA6NNY8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP27XA6NNY8 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP27XA6NNY8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP27XA6NNY8 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP27XA6NNY8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP27XA6NNY8 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP27XA6NNY8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP27XA6NNY8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP27XA6NNY8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
USP27XA6NNY8 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP27XA6NNY8 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP27XA6NNY8 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP27XA6NNY8 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP27XA6NNY8 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP27XA6NNY8 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP27XA6NNY8 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP27XA6NNY8 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP27XA6NNY8 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP27XA6NNY8 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP27XA6NNY8 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP27XA6NNY8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP27XA6NNY8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
USP27XA6NNY8 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP27XA6NNY8 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP27XA6NNY8 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP27XA6NNY8 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP27XA6NNY8 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP27XA6NNY8 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP27XA6NNY8 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP27XA6NNY8 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP27XA6NNY8 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP27XA6NNY8 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP27XA6NNY8 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP27XA6NNY8 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP27XA6NNY8 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP27XA6NNY8 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP27XA6NNY8 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP27XA6NNY8 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP27XA6NNY8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP27XA6NNY8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP27XA6NNY8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP27XA6NNY8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP27XA6NNY8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP27XA6NNY8 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP27XA6NNY8 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP27XA6NNY8 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP27XA6NNY8 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP27XA6NNY8 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP27XA6NNY8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP27XA6NNY8 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP27XA6NNY8 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP27XA6NNY8 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP27XA6NNY8 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP27XA6NNY8 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP27XA6NNY8 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP27XA6NNY8 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP27XA6NNY8 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP27XA6NNY8 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP27XA6NNY8 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP27XA6NNY8 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP27XA6NNY8 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP27XA6NNY8 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP27XA6NNY8 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP27XA6NNY8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
USP27XA6NNY8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
USP27XA6NNY8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP27XA6NNY8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP27XA6NNY8 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP27XA6NNY8 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP27XA6NNY8 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP27XA6NNY8 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP27XA6NNY8 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP27XA6NNY8 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP27XA6NNY8 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP27XA6NNY8 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP27XA6NNY8 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP27XA6NNY8 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP27XA6NNY8 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP27XA6NNY8 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP27XA6NNY8 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP27XA6NNY8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
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