Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RGPD3A6NKT7 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RGPD3A6NKT7 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RGPD3A6NKT7 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RGPD3A6NKT7 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RGPD3A6NKT7 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RGPD3A6NKT7 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
RGPD3A6NKT7 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RGPD3A6NKT7 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RGPD3A6NKT7 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RGPD3A6NKT7 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RGPD3A6NKT7 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RGPD3A6NKT7 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RGPD3A6NKT7 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RGPD3A6NKT7 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RGPD3A6NKT7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RGPD3A6NKT7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RGPD3A6NKT7 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RGPD3A6NKT7 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RGPD3A6NKT7 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RGPD3A6NKT7 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RGPD3A6NKT7 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RGPD3A6NKT7 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
RGPD3A6NKT7 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RGPD3A6NKT7 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RGPD3A6NKT7 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RGPD3A6NKT7 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
RGPD3A6NKT7 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RGPD3A6NKT7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RGPD3A6NKT7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RGPD3A6NKT7 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RGPD3A6NKT7 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RGPD3A6NKT7 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
RGPD3A6NKT7 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
RGPD3A6NKT7 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RGPD3A6NKT7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RGPD3A6NKT7 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RGPD3A6NKT7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RGPD3A6NKT7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RGPD3A6NKT7 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RGPD3A6NKT7 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RGPD3A6NKT7 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RGPD3A6NKT7 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RGPD3A6NKT7 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RGPD3A6NKT7 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RGPD3A6NKT7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RGPD3A6NKT7 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RGPD3A6NKT7 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RGPD3A6NKT7 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RGPD3A6NKT7 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
RGPD3A6NKT7 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RGPD3A6NKT7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RGPD3A6NKT7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RGPD3A6NKT7 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RGPD3A6NKT7 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RGPD3A6NKT7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RGPD3A6NKT7 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RGPD3A6NKT7 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RGPD3A6NKT7 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RGPD3A6NKT7 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RGPD3A6NKT7 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RGPD3A6NKT7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RGPD3A6NKT7 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RGPD3A6NKT7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RGPD3A6NKT7 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
RGPD3A6NKT7 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RGPD3A6NKT7 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
RGPD3A6NKT7 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RGPD3A6NKT7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RGPD3A6NKT7 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RGPD3A6NKT7 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RGPD3A6NKT7 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RGPD3A6NKT7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RGPD3A6NKT7 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RGPD3A6NKT7 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RGPD3A6NKT7 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
RGPD3A6NKT7 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
RGPD3A6NKT7 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RGPD3A6NKT7 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RGPD3A6NKT7 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RGPD3A6NKT7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RGPD3A6NKT7 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RGPD3A6NKT7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RGPD3A6NKT7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RGPD3A6NKT7 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RGPD3A6NKT7 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RGPD3A6NKT7 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RGPD3A6NKT7 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RGPD3A6NKT7 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RGPD3A6NKT7 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RGPD3A6NKT7 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RGPD3A6NKT7 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RGPD3A6NKT7 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RGPD3A6NKT7 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RGPD3A6NKT7 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RGPD3A6NKT7 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
RGPD3A6NKT7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RGPD3A6NKT7 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RGPD3A6NKT7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RGPD3A6NKT7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms