Protein–RNA interactions for Protein: A6NIX2

WTIP, Wilms tumor protein 1-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WTIPA6NIX2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
WTIPA6NIX2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
WTIPA6NIX2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
WTIPA6NIX2 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
WTIPA6NIX2 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
WTIPA6NIX2 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
WTIPA6NIX2 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
WTIPA6NIX2 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
WTIPA6NIX2 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
WTIPA6NIX2 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
WTIPA6NIX2 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
WTIPA6NIX2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
WTIPA6NIX2 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
WTIPA6NIX2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
WTIPA6NIX2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
WTIPA6NIX2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
WTIPA6NIX2 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
WTIPA6NIX2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
WTIPA6NIX2 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
WTIPA6NIX2 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
WTIPA6NIX2 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
WTIPA6NIX2 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
WTIPA6NIX2 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
WTIPA6NIX2 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
WTIPA6NIX2 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
WTIPA6NIX2 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
WTIPA6NIX2 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
WTIPA6NIX2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
WTIPA6NIX2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
WTIPA6NIX2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
WTIPA6NIX2 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
WTIPA6NIX2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
WTIPA6NIX2 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
WTIPA6NIX2 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
WTIPA6NIX2 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
WTIPA6NIX2 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
WTIPA6NIX2 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
WTIPA6NIX2 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
WTIPA6NIX2 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
WTIPA6NIX2 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
WTIPA6NIX2 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
WTIPA6NIX2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
WTIPA6NIX2 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
WTIPA6NIX2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
WTIPA6NIX2 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
WTIPA6NIX2 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
WTIPA6NIX2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
WTIPA6NIX2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
WTIPA6NIX2 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
WTIPA6NIX2 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
WTIPA6NIX2 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
WTIPA6NIX2 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
WTIPA6NIX2 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
WTIPA6NIX2 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
WTIPA6NIX2 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
WTIPA6NIX2 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
WTIPA6NIX2 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
WTIPA6NIX2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
WTIPA6NIX2 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
WTIPA6NIX2 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
WTIPA6NIX2 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
WTIPA6NIX2 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
WTIPA6NIX2 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
WTIPA6NIX2 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
WTIPA6NIX2 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
WTIPA6NIX2 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
WTIPA6NIX2 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
WTIPA6NIX2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
WTIPA6NIX2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
WTIPA6NIX2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
WTIPA6NIX2 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
WTIPA6NIX2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
WTIPA6NIX2 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
WTIPA6NIX2 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
WTIPA6NIX2 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
WTIPA6NIX2 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
WTIPA6NIX2 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
WTIPA6NIX2 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
WTIPA6NIX2 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
WTIPA6NIX2 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
WTIPA6NIX2 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
WTIPA6NIX2 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
WTIPA6NIX2 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
WTIPA6NIX2 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
WTIPA6NIX2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
WTIPA6NIX2 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
WTIPA6NIX2 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
WTIPA6NIX2 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
WTIPA6NIX2 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
WTIPA6NIX2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
WTIPA6NIX2 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
WTIPA6NIX2 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
WTIPA6NIX2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
WTIPA6NIX2 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
WTIPA6NIX2 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
WTIPA6NIX2 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
WTIPA6NIX2 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
WTIPA6NIX2 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
WTIPA6NIX2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
WTIPA6NIX2 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms