Protein–RNA interactions for Protein: A6NIR3

AGAP5, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP5A6NIR3 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AGAP5A6NIR3 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AGAP5A6NIR3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AGAP5A6NIR3 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AGAP5A6NIR3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
AGAP5A6NIR3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
AGAP5A6NIR3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AGAP5A6NIR3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AGAP5A6NIR3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
AGAP5A6NIR3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AGAP5A6NIR3 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AGAP5A6NIR3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AGAP5A6NIR3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AGAP5A6NIR3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AGAP5A6NIR3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AGAP5A6NIR3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AGAP5A6NIR3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
AGAP5A6NIR3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AGAP5A6NIR3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
AGAP5A6NIR3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AGAP5A6NIR3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
AGAP5A6NIR3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AGAP5A6NIR3 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AGAP5A6NIR3 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
AGAP5A6NIR3 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AGAP5A6NIR3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AGAP5A6NIR3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AGAP5A6NIR3 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AGAP5A6NIR3 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
AGAP5A6NIR3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AGAP5A6NIR3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AGAP5A6NIR3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AGAP5A6NIR3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
AGAP5A6NIR3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AGAP5A6NIR3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AGAP5A6NIR3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AGAP5A6NIR3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AGAP5A6NIR3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AGAP5A6NIR3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
AGAP5A6NIR3 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
AGAP5A6NIR3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AGAP5A6NIR3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AGAP5A6NIR3 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AGAP5A6NIR3 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
AGAP5A6NIR3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AGAP5A6NIR3 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
AGAP5A6NIR3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AGAP5A6NIR3 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AGAP5A6NIR3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AGAP5A6NIR3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AGAP5A6NIR3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
AGAP5A6NIR3 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
AGAP5A6NIR3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AGAP5A6NIR3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AGAP5A6NIR3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AGAP5A6NIR3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AGAP5A6NIR3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AGAP5A6NIR3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AGAP5A6NIR3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
AGAP5A6NIR3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
AGAP5A6NIR3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
AGAP5A6NIR3 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AGAP5A6NIR3 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AGAP5A6NIR3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
AGAP5A6NIR3 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
AGAP5A6NIR3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
AGAP5A6NIR3 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
AGAP5A6NIR3 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
AGAP5A6NIR3 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
AGAP5A6NIR3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
AGAP5A6NIR3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
AGAP5A6NIR3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
AGAP5A6NIR3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
AGAP5A6NIR3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
AGAP5A6NIR3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
AGAP5A6NIR3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
AGAP5A6NIR3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
AGAP5A6NIR3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
AGAP5A6NIR3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AGAP5A6NIR3 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AGAP5A6NIR3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AGAP5A6NIR3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
AGAP5A6NIR3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AGAP5A6NIR3 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
AGAP5A6NIR3 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AGAP5A6NIR3 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
AGAP5A6NIR3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
AGAP5A6NIR3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
AGAP5A6NIR3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AGAP5A6NIR3 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
AGAP5A6NIR3 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
AGAP5A6NIR3 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AGAP5A6NIR3 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AGAP5A6NIR3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AGAP5A6NIR3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
AGAP5A6NIR3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AGAP5A6NIR3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AGAP5A6NIR3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AGAP5A6NIR3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AGAP5A6NIR3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms