Protein–RNA interactions for Protein: A6NIN4

Putative uncharacterized protein FLJ38447, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NIN4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
A6NIN4 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
A6NIN4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
A6NIN4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
A6NIN4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
A6NIN4 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
A6NIN4 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
A6NIN4 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
A6NIN4 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
A6NIN4 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
A6NIN4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
A6NIN4 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
A6NIN4 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
A6NIN4 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
A6NIN4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
A6NIN4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
A6NIN4 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
A6NIN4 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
A6NIN4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
A6NIN4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
A6NIN4 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
A6NIN4 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
A6NIN4 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
A6NIN4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
A6NIN4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
A6NIN4 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
A6NIN4 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
A6NIN4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
A6NIN4 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
A6NIN4 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
A6NIN4 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
A6NIN4 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
A6NIN4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
A6NIN4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
A6NIN4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
A6NIN4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
A6NIN4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
A6NIN4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
A6NIN4 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
A6NIN4 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
A6NIN4 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
A6NIN4 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
A6NIN4 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
A6NIN4 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
A6NIN4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
A6NIN4 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
A6NIN4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
A6NIN4 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
A6NIN4 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
A6NIN4 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
A6NIN4 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
A6NIN4 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
A6NIN4 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
A6NIN4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
A6NIN4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
A6NIN4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
A6NIN4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
A6NIN4 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
A6NIN4 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
A6NIN4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
A6NIN4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
A6NIN4 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
A6NIN4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
A6NIN4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
A6NIN4 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
A6NIN4 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
A6NIN4 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
A6NIN4 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
A6NIN4 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
A6NIN4 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
A6NIN4 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
A6NIN4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
A6NIN4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
A6NIN4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
A6NIN4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
A6NIN4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
A6NIN4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
A6NIN4 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
A6NIN4 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
A6NIN4 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
A6NIN4 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
A6NIN4 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
A6NIN4 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
A6NIN4 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
A6NIN4 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
A6NIN4 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
A6NIN4 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
A6NIN4 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
A6NIN4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
A6NIN4 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
A6NIN4 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
A6NIN4 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
A6NIN4 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
A6NIN4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
A6NIN4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
A6NIN4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
A6NIN4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
A6NIN4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
A6NIN4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
A6NIN4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms