Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ZNF316A6NFI3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ZNF316A6NFI3 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ZNF316A6NFI3 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ZNF316A6NFI3 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ZNF316A6NFI3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ZNF316A6NFI3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ZNF316A6NFI3 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ZNF316A6NFI3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ZNF316A6NFI3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ZNF316A6NFI3 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ZNF316A6NFI3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ZNF316A6NFI3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ZNF316A6NFI3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ZNF316A6NFI3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ZNF316A6NFI3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
ZNF316A6NFI3 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ZNF316A6NFI3 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ZNF316A6NFI3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ZNF316A6NFI3 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ZNF316A6NFI3 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ZNF316A6NFI3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ZNF316A6NFI3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ZNF316A6NFI3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ZNF316A6NFI3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ZNF316A6NFI3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ZNF316A6NFI3 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ZNF316A6NFI3 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ZNF316A6NFI3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ZNF316A6NFI3 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ZNF316A6NFI3 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ZNF316A6NFI3 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ZNF316A6NFI3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ZNF316A6NFI3 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
ZNF316A6NFI3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ZNF316A6NFI3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ZNF316A6NFI3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ZNF316A6NFI3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ZNF316A6NFI3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ZNF316A6NFI3 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ZNF316A6NFI3 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ZNF316A6NFI3 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ZNF316A6NFI3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZNF316A6NFI3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZNF316A6NFI3 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZNF316A6NFI3 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZNF316A6NFI3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZNF316A6NFI3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZNF316A6NFI3 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZNF316A6NFI3 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZNF316A6NFI3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZNF316A6NFI3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZNF316A6NFI3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZNF316A6NFI3 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ZNF316A6NFI3 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ZNF316A6NFI3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ZNF316A6NFI3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ZNF316A6NFI3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ZNF316A6NFI3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ZNF316A6NFI3 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ZNF316A6NFI3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
ZNF316A6NFI3 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
ZNF316A6NFI3 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
ZNF316A6NFI3 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
ZNF316A6NFI3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZNF316A6NFI3 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZNF316A6NFI3 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZNF316A6NFI3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZNF316A6NFI3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
ZNF316A6NFI3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZNF316A6NFI3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZNF316A6NFI3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZNF316A6NFI3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
ZNF316A6NFI3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
ZNF316A6NFI3 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZNF316A6NFI3 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZNF316A6NFI3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZNF316A6NFI3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZNF316A6NFI3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZNF316A6NFI3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZNF316A6NFI3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZNF316A6NFI3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
ZNF316A6NFI3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZNF316A6NFI3 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
ZNF316A6NFI3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZNF316A6NFI3 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZNF316A6NFI3 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZNF316A6NFI3 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZNF316A6NFI3 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZNF316A6NFI3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZNF316A6NFI3 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZNF316A6NFI3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZNF316A6NFI3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZNF316A6NFI3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZNF316A6NFI3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZNF316A6NFI3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZNF316A6NFI3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
ZNF316A6NFI3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZNF316A6NFI3 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZNF316A6NFI3 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms