Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms