Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI4

VWA3A, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3AA6NCI4 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VWA3AA6NCI4 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VWA3AA6NCI4 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VWA3AA6NCI4 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VWA3AA6NCI4 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VWA3AA6NCI4 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VWA3AA6NCI4 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VWA3AA6NCI4 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VWA3AA6NCI4 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VWA3AA6NCI4 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VWA3AA6NCI4 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VWA3AA6NCI4 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VWA3AA6NCI4 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VWA3AA6NCI4 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VWA3AA6NCI4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
VWA3AA6NCI4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VWA3AA6NCI4 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VWA3AA6NCI4 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VWA3AA6NCI4 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VWA3AA6NCI4 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VWA3AA6NCI4 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VWA3AA6NCI4 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VWA3AA6NCI4 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VWA3AA6NCI4 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VWA3AA6NCI4 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VWA3AA6NCI4 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VWA3AA6NCI4 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VWA3AA6NCI4 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VWA3AA6NCI4 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VWA3AA6NCI4 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
VWA3AA6NCI4 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
VWA3AA6NCI4 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VWA3AA6NCI4 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
VWA3AA6NCI4 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VWA3AA6NCI4 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VWA3AA6NCI4 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VWA3AA6NCI4 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VWA3AA6NCI4 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VWA3AA6NCI4 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VWA3AA6NCI4 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VWA3AA6NCI4 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VWA3AA6NCI4 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VWA3AA6NCI4 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
VWA3AA6NCI4 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VWA3AA6NCI4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VWA3AA6NCI4 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VWA3AA6NCI4 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VWA3AA6NCI4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VWA3AA6NCI4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VWA3AA6NCI4 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VWA3AA6NCI4 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VWA3AA6NCI4 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VWA3AA6NCI4 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VWA3AA6NCI4 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VWA3AA6NCI4 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
VWA3AA6NCI4 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VWA3AA6NCI4 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VWA3AA6NCI4 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VWA3AA6NCI4 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VWA3AA6NCI4 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VWA3AA6NCI4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VWA3AA6NCI4 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VWA3AA6NCI4 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VWA3AA6NCI4 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VWA3AA6NCI4 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
VWA3AA6NCI4 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VWA3AA6NCI4 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VWA3AA6NCI4 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VWA3AA6NCI4 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VWA3AA6NCI4 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VWA3AA6NCI4 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VWA3AA6NCI4 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VWA3AA6NCI4 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VWA3AA6NCI4 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VWA3AA6NCI4 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VWA3AA6NCI4 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VWA3AA6NCI4 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VWA3AA6NCI4 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VWA3AA6NCI4 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VWA3AA6NCI4 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VWA3AA6NCI4 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VWA3AA6NCI4 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
VWA3AA6NCI4 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VWA3AA6NCI4 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VWA3AA6NCI4 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VWA3AA6NCI4 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VWA3AA6NCI4 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VWA3AA6NCI4 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VWA3AA6NCI4 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VWA3AA6NCI4 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
VWA3AA6NCI4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VWA3AA6NCI4 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VWA3AA6NCI4 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VWA3AA6NCI4 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VWA3AA6NCI4 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VWA3AA6NCI4 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VWA3AA6NCI4 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VWA3AA6NCI4 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VWA3AA6NCI4 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VWA3AA6NCI4 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms