Protein–RNA interactions for Protein: A2RUB6

CCDC66, Coiled-coil domain-containing protein 66, humanhuman

Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC66A2RUB6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms