Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 GTF2H2B-204ENST00000513202 1954 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
TMEM225BP0DP42 CNTNAP4-202ENST00000377504 4723 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
TMEM225BP0DP42 AC112206.2-203ENST00000513234 1556 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
TMEM225BP0DP42 AC007614.6-201ENST00000623729 2620 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TMEM225BP0DP42 MCM6-201ENST00000264156 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
TMEM225BP0DP42 AC016722.3-201ENST00000568862 2463 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
TMEM225BP0DP42 FAM222B-201ENST00000341217 4033 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
TMEM225BP0DP42 PBRM1-203ENST00000356770 7523 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
TMEM225BP0DP42 LPP-208ENST00000448637 5835 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
TMEM225BP0DP42 URB1-201ENST00000382751 10832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
TMEM225BP0DP42 ERMAP-201ENST00000328249 3949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
TMEM225BP0DP42 MPP7-203ENST00000375732 5063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.13
TMEM225BP0DP42 MAPK10-325ENST00000641537 2623 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TMEM225BP0DP42 KIAA1328-207ENST00000591619 5881 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
TMEM225BP0DP42 OR13D1-201ENST00000318763 1107 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TMEM225BP0DP42 HIST1H2BI-201ENST00000377733 381 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TMEM225BP0DP42 TRAV29DV5-201ENST00000390458 469 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TMEM225BP0DP42 RNA5SP158-201ENST00000410298 102 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TMEM225BP0DP42 AGBL5-IT1-201ENST00000411862 339 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TMEM225BP0DP42 AL590133.1-201ENST00000412838 368 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TMEM225BP0DP42 FAM96AP2-201ENST00000414727 477 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TMEM225BP0DP42 CYP3A43-206ENST00000417625 1255 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
TMEM225BP0DP42 AC018866.1-202ENST00000421820 470 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TMEM225BP0DP42 RPL29P28-201ENST00000421928 472 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TMEM225BP0DP42 AC006378.1-201ENST00000426193 563 ntTSL 4 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TMEM225BP0DP42 AC118555.1-201ENST00000426386 696 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TMEM225BP0DP42 GACAT3-201ENST00000426539 1096 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TMEM225BP0DP42 FERP1-201ENST00000436391 793 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TMEM225BP0DP42 PGM5P4-AS1-203ENST00000446595 739 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TMEM225BP0DP42 AL031597.1-201ENST00000447383 432 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TMEM225BP0DP42 AL445183.1-201ENST00000447867 467 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TMEM225BP0DP42 CEACAM22P-203ENST00000455455 545 ntTSL 4 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TMEM225BP0DP42 ALDH7A1P2-201ENST00000456501 621 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TMEM225BP0DP42 AC093627.5-201ENST00000462565 662 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TMEM225BP0DP42 AC002384.1-201ENST00000490162 429 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TMEM225BP0DP42 THAP6-211ENST00000507885 896 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
TMEM225BP0DP42 WBP1LP2-201ENST00000515260 998 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TMEM225BP0DP42 ACA64.6-201ENST00000516310 117 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TMEM225BP0DP42 AC087273.1-201ENST00000519368 529 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TMEM225BP0DP42 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TMEM225BP0DP42 AC120036.4-201ENST00000521874 256 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TMEM225BP0DP42 AC115837.2-201ENST00000522127 677 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TMEM225BP0DP42 LYNX1-207ENST00000523332 600 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TMEM225BP0DP42 AC010768.2-201ENST00000532524 567 ntTSL 4 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TMEM225BP0DP42 TIMM8B-204ENST00000541231 805 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
TMEM225BP0DP42 AL136418.1-201ENST00000551799 975 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TMEM225BP0DP42 AC092139.1-201ENST00000567149 497 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TMEM225BP0DP42 AC009303.2-209ENST00000588733 853 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TMEM225BP0DP42 AC020907.4-201ENST00000605640 526 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TMEM225BP0DP42 BSNDP1-201ENST00000613026 367 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TMEM225BP0DP42 MAPK10-202ENST00000359221 2668 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TMEM225BP0DP42 BRPF1-206ENST00000457855 4308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TMEM225BP0DP42 PTPRB-208ENST00000550358 6583 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TMEM225BP0DP42 LINC01007-201ENST00000434537 2291 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
TMEM225BP0DP42 CICP22-201ENST00000432801 1319 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TMEM225BP0DP42 AL021707.2-203ENST00000444381 1325 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
TMEM225BP0DP42 ARL6-202ENST00000394206 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TMEM225BP0DP42 ABI1-208ENST00000376160 3515 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TMEM225BP0DP42 XRCC5-202ENST00000392133 3761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TMEM225BP0DP42 LAMA3-207ENST00000587184 5007 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
TMEM225BP0DP42 ERC1-202ENST00000355446 5796 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
TMEM225BP0DP42 KCNE1-201ENST00000337385 3347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TMEM225BP0DP42 ATAD2-205ENST00000521903 5143 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
TMEM225BP0DP42 PIWIL3-205ENST00000616349 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
TMEM225BP0DP42 RTN4-206ENST00000394611 4161 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
TMEM225BP0DP42 ATP6V0D2-201ENST00000285393 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TMEM225BP0DP42 TMCO1-208ENST00000612311 4468 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TMEM225BP0DP42 AC093117.1-201ENST00000413541 2171 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TMEM225BP0DP42 PMCHL2-202ENST00000450213 1917 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TMEM225BP0DP42 ZNF468-201ENST00000243639 4027 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TMEM225BP0DP42 EFTUD2-201ENST00000402521 3045 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TMEM225BP0DP42 ZNF233-201ENST00000391958 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TMEM225BP0DP42 SCN11A-201ENST00000302328 6500 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TMEM225BP0DP42 FCAR-203ENST00000355524 1483 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TMEM225BP0DP42 TP63-202ENST00000320472 2032 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TMEM225BP0DP42 TP63-210ENST00000440651 2031 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TMEM225BP0DP42 AC025569.1-202ENST00000548687 5903 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TMEM225BP0DP42 AL096869.3-201ENST00000567837 2626 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TMEM225BP0DP42 RFX3-201ENST00000302303 1522 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TMEM225BP0DP42 PLEKHA8P1-202ENST00000336399 1524 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TMEM225BP0DP42 DLG1-202ENST00000357674 4931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TMEM225BP0DP42 CLCN5-204ENST00000376108 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TMEM225BP0DP42 LRRC4C-203ENST00000528697 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TMEM225BP0DP42 SMUG1-201ENST00000243112 627 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TMEM225BP0DP42 HIGD1B-201ENST00000253410 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TMEM225BP0DP42 GNG8-201ENST00000300873 216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TMEM225BP0DP42 CSH1-202ENST00000329882 1073 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TMEM225BP0DP42 Z97985.1-201ENST00000332270 946 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TMEM225BP0DP42 CLDN2-201ENST00000336803 2959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TMEM225BP0DP42 PAGE1-201ENST00000376150 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TMEM225BP0DP42 MIR711-201ENST00000390201 76 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TMEM225BP0DP42 RPS27-202ENST00000392558 625 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TMEM225BP0DP42 MCF2L-206ENST00000397021 576 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TMEM225BP0DP42 RN7SKP252-201ENST00000411210 327 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TMEM225BP0DP42 RPS19P1-201ENST00000415286 434 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TMEM225BP0DP42 TIA1-204ENST00000416149 821 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TMEM225BP0DP42 PTMAP4-201ENST00000426188 346 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TMEM225BP0DP42 ABCC5-205ENST00000427120 4697 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TMEM225BP0DP42 LINC01823-203ENST00000435895 766 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TMEM225BP0DP42 RPL3P12-201ENST00000436852 1208 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 196.4 ms