Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E7

PCDHB2, Protocadherin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB2Q9Y5E7 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCDHB2Q9Y5E7 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCDHB2Q9Y5E7 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCDHB2Q9Y5E7 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCDHB2Q9Y5E7 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCDHB2Q9Y5E7 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCDHB2Q9Y5E7 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCDHB2Q9Y5E7 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCDHB2Q9Y5E7 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCDHB2Q9Y5E7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCDHB2Q9Y5E7 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCDHB2Q9Y5E7 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCDHB2Q9Y5E7 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCDHB2Q9Y5E7 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCDHB2Q9Y5E7 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCDHB2Q9Y5E7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCDHB2Q9Y5E7 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCDHB2Q9Y5E7 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCDHB2Q9Y5E7 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCDHB2Q9Y5E7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCDHB2Q9Y5E7 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCDHB2Q9Y5E7 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCDHB2Q9Y5E7 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCDHB2Q9Y5E7 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCDHB2Q9Y5E7 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCDHB2Q9Y5E7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCDHB2Q9Y5E7 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCDHB2Q9Y5E7 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCDHB2Q9Y5E7 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCDHB2Q9Y5E7 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCDHB2Q9Y5E7 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCDHB2Q9Y5E7 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCDHB2Q9Y5E7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCDHB2Q9Y5E7 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCDHB2Q9Y5E7 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PCDHB2Q9Y5E7 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCDHB2Q9Y5E7 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCDHB2Q9Y5E7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCDHB2Q9Y5E7 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCDHB2Q9Y5E7 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCDHB2Q9Y5E7 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCDHB2Q9Y5E7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms