Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y446

PKP3, Plakophilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3Q9Y446 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PKP3Q9Y446 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PKP3Q9Y446 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PKP3Q9Y446 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PKP3Q9Y446 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PKP3Q9Y446 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PKP3Q9Y446 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PKP3Q9Y446 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PKP3Q9Y446 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PKP3Q9Y446 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PKP3Q9Y446 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PKP3Q9Y446 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PKP3Q9Y446 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PKP3Q9Y446 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PKP3Q9Y446 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PKP3Q9Y446 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PKP3Q9Y446 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PKP3Q9Y446 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PKP3Q9Y446 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PKP3Q9Y446 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PKP3Q9Y446 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PKP3Q9Y446 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PKP3Q9Y446 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PKP3Q9Y446 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PKP3Q9Y446 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PKP3Q9Y446 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PKP3Q9Y446 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PKP3Q9Y446 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PKP3Q9Y446 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PKP3Q9Y446 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PKP3Q9Y446 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PKP3Q9Y446 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PKP3Q9Y446 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PKP3Q9Y446 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PKP3Q9Y446 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PKP3Q9Y446 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PKP3Q9Y446 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PKP3Q9Y446 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PKP3Q9Y446 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PKP3Q9Y446 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PKP3Q9Y446 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PKP3Q9Y446 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PKP3Q9Y446 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PKP3Q9Y446 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PKP3Q9Y446 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PKP3Q9Y446 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKP3Q9Y446 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKP3Q9Y446 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKP3Q9Y446 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKP3Q9Y446 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKP3Q9Y446 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKP3Q9Y446 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKP3Q9Y446 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKP3Q9Y446 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKP3Q9Y446 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PKP3Q9Y446 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKP3Q9Y446 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKP3Q9Y446 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKP3Q9Y446 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKP3Q9Y446 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKP3Q9Y446 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKP3Q9Y446 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKP3Q9Y446 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKP3Q9Y446 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKP3Q9Y446 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKP3Q9Y446 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKP3Q9Y446 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PKP3Q9Y446 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PKP3Q9Y446 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PKP3Q9Y446 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PKP3Q9Y446 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PKP3Q9Y446 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PKP3Q9Y446 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PKP3Q9Y446 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PKP3Q9Y446 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PKP3Q9Y446 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PKP3Q9Y446 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PKP3Q9Y446 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PKP3Q9Y446 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PKP3Q9Y446 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PKP3Q9Y446 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PKP3Q9Y446 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PKP3Q9Y446 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PKP3Q9Y446 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PKP3Q9Y446 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PKP3Q9Y446 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PKP3Q9Y446 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PKP3Q9Y446 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PKP3Q9Y446 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PKP3Q9Y446 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PKP3Q9Y446 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PKP3Q9Y446 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PKP3Q9Y446 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PKP3Q9Y446 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PKP3Q9Y446 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PKP3Q9Y446 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PKP3Q9Y446 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PKP3Q9Y446 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PKP3Q9Y446 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PKP3Q9Y446 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms