Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Y2

CHTOP, Chromatin target of PRMT1 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTOPQ9Y3Y2 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CHTOPQ9Y3Y2 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CHTOPQ9Y3Y2 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CHTOPQ9Y3Y2 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CHTOPQ9Y3Y2 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CHTOPQ9Y3Y2 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CHTOPQ9Y3Y2 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CHTOPQ9Y3Y2 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHTOPQ9Y3Y2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHTOPQ9Y3Y2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHTOPQ9Y3Y2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHTOPQ9Y3Y2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHTOPQ9Y3Y2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHTOPQ9Y3Y2 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHTOPQ9Y3Y2 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHTOPQ9Y3Y2 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHTOPQ9Y3Y2 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHTOPQ9Y3Y2 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHTOPQ9Y3Y2 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHTOPQ9Y3Y2 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHTOPQ9Y3Y2 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHTOPQ9Y3Y2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHTOPQ9Y3Y2 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHTOPQ9Y3Y2 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHTOPQ9Y3Y2 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHTOPQ9Y3Y2 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHTOPQ9Y3Y2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHTOPQ9Y3Y2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHTOPQ9Y3Y2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHTOPQ9Y3Y2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHTOPQ9Y3Y2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHTOPQ9Y3Y2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHTOPQ9Y3Y2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHTOPQ9Y3Y2 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CHTOPQ9Y3Y2 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHTOPQ9Y3Y2 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHTOPQ9Y3Y2 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHTOPQ9Y3Y2 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHTOPQ9Y3Y2 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHTOPQ9Y3Y2 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHTOPQ9Y3Y2 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHTOPQ9Y3Y2 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHTOPQ9Y3Y2 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHTOPQ9Y3Y2 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHTOPQ9Y3Y2 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHTOPQ9Y3Y2 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHTOPQ9Y3Y2 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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