Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y397

ZDHHC9, Palmitoyltransferase ZDHHC9, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC9Q9Y397 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZDHHC9Q9Y397 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZDHHC9Q9Y397 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZDHHC9Q9Y397 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZDHHC9Q9Y397 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZDHHC9Q9Y397 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ZDHHC9Q9Y397 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZDHHC9Q9Y397 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZDHHC9Q9Y397 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZDHHC9Q9Y397 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ZDHHC9Q9Y397 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZDHHC9Q9Y397 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZDHHC9Q9Y397 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZDHHC9Q9Y397 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZDHHC9Q9Y397 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZDHHC9Q9Y397 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZDHHC9Q9Y397 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZDHHC9Q9Y397 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZDHHC9Q9Y397 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZDHHC9Q9Y397 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ZDHHC9Q9Y397 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZDHHC9Q9Y397 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZDHHC9Q9Y397 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZDHHC9Q9Y397 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZDHHC9Q9Y397 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZDHHC9Q9Y397 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZDHHC9Q9Y397 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZDHHC9Q9Y397 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZDHHC9Q9Y397 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZDHHC9Q9Y397 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZDHHC9Q9Y397 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZDHHC9Q9Y397 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZDHHC9Q9Y397 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZDHHC9Q9Y397 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZDHHC9Q9Y397 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZDHHC9Q9Y397 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZDHHC9Q9Y397 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZDHHC9Q9Y397 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZDHHC9Q9Y397 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZDHHC9Q9Y397 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZDHHC9Q9Y397 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZDHHC9Q9Y397 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZDHHC9Q9Y397 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZDHHC9Q9Y397 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZDHHC9Q9Y397 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZDHHC9Q9Y397 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZDHHC9Q9Y397 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZDHHC9Q9Y397 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZDHHC9Q9Y397 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZDHHC9Q9Y397 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZDHHC9Q9Y397 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ZDHHC9Q9Y397 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZDHHC9Q9Y397 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZDHHC9Q9Y397 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZDHHC9Q9Y397 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZDHHC9Q9Y397 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZDHHC9Q9Y397 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZDHHC9Q9Y397 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZDHHC9Q9Y397 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZDHHC9Q9Y397 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ZDHHC9Q9Y397 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZDHHC9Q9Y397 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZDHHC9Q9Y397 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ZDHHC9Q9Y397 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZDHHC9Q9Y397 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZDHHC9Q9Y397 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ZDHHC9Q9Y397 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZDHHC9Q9Y397 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZDHHC9Q9Y397 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZDHHC9Q9Y397 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZDHHC9Q9Y397 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZDHHC9Q9Y397 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZDHHC9Q9Y397 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ZDHHC9Q9Y397 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZDHHC9Q9Y397 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZDHHC9Q9Y397 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZDHHC9Q9Y397 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZDHHC9Q9Y397 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ZDHHC9Q9Y397 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZDHHC9Q9Y397 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZDHHC9Q9Y397 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZDHHC9Q9Y397 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZDHHC9Q9Y397 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZDHHC9Q9Y397 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZDHHC9Q9Y397 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZDHHC9Q9Y397 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZDHHC9Q9Y397 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZDHHC9Q9Y397 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZDHHC9Q9Y397 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZDHHC9Q9Y397 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZDHHC9Q9Y397 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZDHHC9Q9Y397 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZDHHC9Q9Y397 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZDHHC9Q9Y397 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZDHHC9Q9Y397 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ZDHHC9Q9Y397 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZDHHC9Q9Y397 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZDHHC9Q9Y397 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZDHHC9Q9Y397 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZDHHC9Q9Y397 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms