Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U9

KLHDC2, Kelch domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC2Q9Y2U9 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHDC2Q9Y2U9 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHDC2Q9Y2U9 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHDC2Q9Y2U9 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHDC2Q9Y2U9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHDC2Q9Y2U9 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHDC2Q9Y2U9 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHDC2Q9Y2U9 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHDC2Q9Y2U9 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHDC2Q9Y2U9 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHDC2Q9Y2U9 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHDC2Q9Y2U9 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHDC2Q9Y2U9 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHDC2Q9Y2U9 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHDC2Q9Y2U9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHDC2Q9Y2U9 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHDC2Q9Y2U9 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHDC2Q9Y2U9 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHDC2Q9Y2U9 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHDC2Q9Y2U9 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHDC2Q9Y2U9 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHDC2Q9Y2U9 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHDC2Q9Y2U9 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHDC2Q9Y2U9 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHDC2Q9Y2U9 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
KLHDC2Q9Y2U9 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHDC2Q9Y2U9 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHDC2Q9Y2U9 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHDC2Q9Y2U9 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHDC2Q9Y2U9 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHDC2Q9Y2U9 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHDC2Q9Y2U9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHDC2Q9Y2U9 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHDC2Q9Y2U9 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHDC2Q9Y2U9 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHDC2Q9Y2U9 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHDC2Q9Y2U9 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHDC2Q9Y2U9 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHDC2Q9Y2U9 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHDC2Q9Y2U9 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHDC2Q9Y2U9 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHDC2Q9Y2U9 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHDC2Q9Y2U9 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHDC2Q9Y2U9 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHDC2Q9Y2U9 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHDC2Q9Y2U9 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHDC2Q9Y2U9 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHDC2Q9Y2U9 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHDC2Q9Y2U9 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHDC2Q9Y2U9 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHDC2Q9Y2U9 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHDC2Q9Y2U9 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHDC2Q9Y2U9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHDC2Q9Y2U9 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHDC2Q9Y2U9 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHDC2Q9Y2U9 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHDC2Q9Y2U9 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHDC2Q9Y2U9 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHDC2Q9Y2U9 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHDC2Q9Y2U9 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHDC2Q9Y2U9 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHDC2Q9Y2U9 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHDC2Q9Y2U9 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHDC2Q9Y2U9 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHDC2Q9Y2U9 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHDC2Q9Y2U9 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHDC2Q9Y2U9 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHDC2Q9Y2U9 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHDC2Q9Y2U9 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHDC2Q9Y2U9 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHDC2Q9Y2U9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHDC2Q9Y2U9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHDC2Q9Y2U9 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHDC2Q9Y2U9 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHDC2Q9Y2U9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHDC2Q9Y2U9 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHDC2Q9Y2U9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHDC2Q9Y2U9 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHDC2Q9Y2U9 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHDC2Q9Y2U9 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHDC2Q9Y2U9 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHDC2Q9Y2U9 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHDC2Q9Y2U9 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHDC2Q9Y2U9 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHDC2Q9Y2U9 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHDC2Q9Y2U9 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHDC2Q9Y2U9 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHDC2Q9Y2U9 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHDC2Q9Y2U9 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHDC2Q9Y2U9 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHDC2Q9Y2U9 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHDC2Q9Y2U9 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHDC2Q9Y2U9 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHDC2Q9Y2U9 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHDC2Q9Y2U9 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHDC2Q9Y2U9 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHDC2Q9Y2U9 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHDC2Q9Y2U9 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHDC2Q9Y2U9 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHDC2Q9Y2U9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms