Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRAK1Q9UPV9 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRAK1Q9UPV9 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRAK1Q9UPV9 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRAK1Q9UPV9 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRAK1Q9UPV9 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRAK1Q9UPV9 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRAK1Q9UPV9 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
TRAK1Q9UPV9 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRAK1Q9UPV9 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRAK1Q9UPV9 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRAK1Q9UPV9 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRAK1Q9UPV9 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRAK1Q9UPV9 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRAK1Q9UPV9 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRAK1Q9UPV9 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRAK1Q9UPV9 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRAK1Q9UPV9 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRAK1Q9UPV9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRAK1Q9UPV9 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRAK1Q9UPV9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRAK1Q9UPV9 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRAK1Q9UPV9 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
TRAK1Q9UPV9 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRAK1Q9UPV9 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRAK1Q9UPV9 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRAK1Q9UPV9 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRAK1Q9UPV9 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRAK1Q9UPV9 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRAK1Q9UPV9 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRAK1Q9UPV9 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRAK1Q9UPV9 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRAK1Q9UPV9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRAK1Q9UPV9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRAK1Q9UPV9 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRAK1Q9UPV9 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRAK1Q9UPV9 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRAK1Q9UPV9 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRAK1Q9UPV9 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRAK1Q9UPV9 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRAK1Q9UPV9 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRAK1Q9UPV9 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRAK1Q9UPV9 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRAK1Q9UPV9 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRAK1Q9UPV9 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
TRAK1Q9UPV9 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRAK1Q9UPV9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRAK1Q9UPV9 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRAK1Q9UPV9 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRAK1Q9UPV9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRAK1Q9UPV9 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRAK1Q9UPV9 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRAK1Q9UPV9 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRAK1Q9UPV9 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRAK1Q9UPV9 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRAK1Q9UPV9 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRAK1Q9UPV9 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRAK1Q9UPV9 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRAK1Q9UPV9 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRAK1Q9UPV9 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRAK1Q9UPV9 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRAK1Q9UPV9 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRAK1Q9UPV9 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRAK1Q9UPV9 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRAK1Q9UPV9 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRAK1Q9UPV9 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRAK1Q9UPV9 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
TRAK1Q9UPV9 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
TRAK1Q9UPV9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRAK1Q9UPV9 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRAK1Q9UPV9 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRAK1Q9UPV9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRAK1Q9UPV9 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRAK1Q9UPV9 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
TRAK1Q9UPV9 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRAK1Q9UPV9 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRAK1Q9UPV9 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRAK1Q9UPV9 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRAK1Q9UPV9 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRAK1Q9UPV9 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRAK1Q9UPV9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRAK1Q9UPV9 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRAK1Q9UPV9 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRAK1Q9UPV9 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRAK1Q9UPV9 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRAK1Q9UPV9 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRAK1Q9UPV9 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRAK1Q9UPV9 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRAK1Q9UPV9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRAK1Q9UPV9 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRAK1Q9UPV9 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRAK1Q9UPV9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRAK1Q9UPV9 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRAK1Q9UPV9 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRAK1Q9UPV9 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRAK1Q9UPV9 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRAK1Q9UPV9 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRAK1Q9UPV9 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRAK1Q9UPV9 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRAK1Q9UPV9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms