Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN6

SCAF8, Protein SCAF8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8Q9UPN6 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCAF8Q9UPN6 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCAF8Q9UPN6 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCAF8Q9UPN6 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SCAF8Q9UPN6 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCAF8Q9UPN6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCAF8Q9UPN6 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCAF8Q9UPN6 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCAF8Q9UPN6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCAF8Q9UPN6 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCAF8Q9UPN6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCAF8Q9UPN6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCAF8Q9UPN6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCAF8Q9UPN6 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCAF8Q9UPN6 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCAF8Q9UPN6 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SCAF8Q9UPN6 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCAF8Q9UPN6 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCAF8Q9UPN6 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCAF8Q9UPN6 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCAF8Q9UPN6 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCAF8Q9UPN6 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCAF8Q9UPN6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCAF8Q9UPN6 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SCAF8Q9UPN6 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCAF8Q9UPN6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCAF8Q9UPN6 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCAF8Q9UPN6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCAF8Q9UPN6 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCAF8Q9UPN6 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCAF8Q9UPN6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCAF8Q9UPN6 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SCAF8Q9UPN6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCAF8Q9UPN6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCAF8Q9UPN6 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCAF8Q9UPN6 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCAF8Q9UPN6 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCAF8Q9UPN6 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCAF8Q9UPN6 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCAF8Q9UPN6 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCAF8Q9UPN6 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCAF8Q9UPN6 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCAF8Q9UPN6 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCAF8Q9UPN6 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCAF8Q9UPN6 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCAF8Q9UPN6 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCAF8Q9UPN6 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SCAF8Q9UPN6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCAF8Q9UPN6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCAF8Q9UPN6 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCAF8Q9UPN6 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCAF8Q9UPN6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCAF8Q9UPN6 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCAF8Q9UPN6 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCAF8Q9UPN6 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCAF8Q9UPN6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCAF8Q9UPN6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCAF8Q9UPN6 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCAF8Q9UPN6 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCAF8Q9UPN6 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCAF8Q9UPN6 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCAF8Q9UPN6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCAF8Q9UPN6 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCAF8Q9UPN6 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCAF8Q9UPN6 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCAF8Q9UPN6 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCAF8Q9UPN6 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCAF8Q9UPN6 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCAF8Q9UPN6 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCAF8Q9UPN6 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCAF8Q9UPN6 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCAF8Q9UPN6 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCAF8Q9UPN6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCAF8Q9UPN6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCAF8Q9UPN6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCAF8Q9UPN6 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCAF8Q9UPN6 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCAF8Q9UPN6 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCAF8Q9UPN6 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCAF8Q9UPN6 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCAF8Q9UPN6 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCAF8Q9UPN6 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCAF8Q9UPN6 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCAF8Q9UPN6 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCAF8Q9UPN6 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SCAF8Q9UPN6 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCAF8Q9UPN6 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCAF8Q9UPN6 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCAF8Q9UPN6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCAF8Q9UPN6 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCAF8Q9UPN6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCAF8Q9UPN6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCAF8Q9UPN6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCAF8Q9UPN6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCAF8Q9UPN6 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCAF8Q9UPN6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCAF8Q9UPN6 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCAF8Q9UPN6 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCAF8Q9UPN6 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCAF8Q9UPN6 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms