Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC6

PADI1, Protein-arginine deiminase type-1, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI1Q9ULC6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PADI1Q9ULC6 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PADI1Q9ULC6 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PADI1Q9ULC6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PADI1Q9ULC6 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PADI1Q9ULC6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PADI1Q9ULC6 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PADI1Q9ULC6 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PADI1Q9ULC6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PADI1Q9ULC6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PADI1Q9ULC6 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PADI1Q9ULC6 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PADI1Q9ULC6 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PADI1Q9ULC6 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PADI1Q9ULC6 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PADI1Q9ULC6 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PADI1Q9ULC6 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PADI1Q9ULC6 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PADI1Q9ULC6 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PADI1Q9ULC6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PADI1Q9ULC6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PADI1Q9ULC6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PADI1Q9ULC6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PADI1Q9ULC6 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PADI1Q9ULC6 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PADI1Q9ULC6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PADI1Q9ULC6 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PADI1Q9ULC6 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PADI1Q9ULC6 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PADI1Q9ULC6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PADI1Q9ULC6 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PADI1Q9ULC6 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PADI1Q9ULC6 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PADI1Q9ULC6 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PADI1Q9ULC6 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PADI1Q9ULC6 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PADI1Q9ULC6 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PADI1Q9ULC6 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PADI1Q9ULC6 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PADI1Q9ULC6 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PADI1Q9ULC6 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PADI1Q9ULC6 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PADI1Q9ULC6 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PADI1Q9ULC6 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PADI1Q9ULC6 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PADI1Q9ULC6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PADI1Q9ULC6 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PADI1Q9ULC6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PADI1Q9ULC6 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PADI1Q9ULC6 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PADI1Q9ULC6 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PADI1Q9ULC6 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PADI1Q9ULC6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PADI1Q9ULC6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PADI1Q9ULC6 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PADI1Q9ULC6 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PADI1Q9ULC6 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PADI1Q9ULC6 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PADI1Q9ULC6 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PADI1Q9ULC6 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PADI1Q9ULC6 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PADI1Q9ULC6 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PADI1Q9ULC6 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PADI1Q9ULC6 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PADI1Q9ULC6 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PADI1Q9ULC6 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PADI1Q9ULC6 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PADI1Q9ULC6 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PADI1Q9ULC6 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PADI1Q9ULC6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PADI1Q9ULC6 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PADI1Q9ULC6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PADI1Q9ULC6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PADI1Q9ULC6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PADI1Q9ULC6 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PADI1Q9ULC6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PADI1Q9ULC6 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PADI1Q9ULC6 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PADI1Q9ULC6 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PADI1Q9ULC6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PADI1Q9ULC6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PADI1Q9ULC6 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PADI1Q9ULC6 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PADI1Q9ULC6 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PADI1Q9ULC6 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PADI1Q9ULC6 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PADI1Q9ULC6 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PADI1Q9ULC6 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PADI1Q9ULC6 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PADI1Q9ULC6 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PADI1Q9ULC6 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PADI1Q9ULC6 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PADI1Q9ULC6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PADI1Q9ULC6 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PADI1Q9ULC6 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PADI1Q9ULC6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PADI1Q9ULC6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PADI1Q9ULC6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PADI1Q9ULC6 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PADI1Q9ULC6 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms