Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK23

NAGPA, N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N-acetylglucosaminidase, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAGPAQ9UK23 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NAGPAQ9UK23 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NAGPAQ9UK23 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NAGPAQ9UK23 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NAGPAQ9UK23 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NAGPAQ9UK23 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NAGPAQ9UK23 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NAGPAQ9UK23 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NAGPAQ9UK23 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NAGPAQ9UK23 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NAGPAQ9UK23 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NAGPAQ9UK23 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NAGPAQ9UK23 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NAGPAQ9UK23 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NAGPAQ9UK23 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NAGPAQ9UK23 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NAGPAQ9UK23 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NAGPAQ9UK23 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NAGPAQ9UK23 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NAGPAQ9UK23 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NAGPAQ9UK23 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NAGPAQ9UK23 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NAGPAQ9UK23 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NAGPAQ9UK23 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NAGPAQ9UK23 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NAGPAQ9UK23 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NAGPAQ9UK23 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NAGPAQ9UK23 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NAGPAQ9UK23 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NAGPAQ9UK23 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NAGPAQ9UK23 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NAGPAQ9UK23 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NAGPAQ9UK23 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NAGPAQ9UK23 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NAGPAQ9UK23 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NAGPAQ9UK23 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NAGPAQ9UK23 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NAGPAQ9UK23 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NAGPAQ9UK23 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NAGPAQ9UK23 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NAGPAQ9UK23 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NAGPAQ9UK23 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NAGPAQ9UK23 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NAGPAQ9UK23 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NAGPAQ9UK23 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NAGPAQ9UK23 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NAGPAQ9UK23 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NAGPAQ9UK23 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NAGPAQ9UK23 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NAGPAQ9UK23 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NAGPAQ9UK23 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NAGPAQ9UK23 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NAGPAQ9UK23 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NAGPAQ9UK23 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NAGPAQ9UK23 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NAGPAQ9UK23 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NAGPAQ9UK23 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NAGPAQ9UK23 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NAGPAQ9UK23 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NAGPAQ9UK23 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NAGPAQ9UK23 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NAGPAQ9UK23 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NAGPAQ9UK23 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NAGPAQ9UK23 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NAGPAQ9UK23 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NAGPAQ9UK23 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NAGPAQ9UK23 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NAGPAQ9UK23 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NAGPAQ9UK23 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NAGPAQ9UK23 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NAGPAQ9UK23 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NAGPAQ9UK23 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NAGPAQ9UK23 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NAGPAQ9UK23 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NAGPAQ9UK23 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NAGPAQ9UK23 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NAGPAQ9UK23 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NAGPAQ9UK23 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NAGPAQ9UK23 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NAGPAQ9UK23 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NAGPAQ9UK23 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NAGPAQ9UK23 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NAGPAQ9UK23 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NAGPAQ9UK23 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NAGPAQ9UK23 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NAGPAQ9UK23 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NAGPAQ9UK23 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NAGPAQ9UK23 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NAGPAQ9UK23 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NAGPAQ9UK23 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NAGPAQ9UK23 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NAGPAQ9UK23 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NAGPAQ9UK23 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NAGPAQ9UK23 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NAGPAQ9UK23 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NAGPAQ9UK23 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NAGPAQ9UK23 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NAGPAQ9UK23 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NAGPAQ9UK23 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NAGPAQ9UK23 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms