Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SCN11AQ9UI33 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SCN11AQ9UI33 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCN11AQ9UI33 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCN11AQ9UI33 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCN11AQ9UI33 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCN11AQ9UI33 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCN11AQ9UI33 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCN11AQ9UI33 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCN11AQ9UI33 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCN11AQ9UI33 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCN11AQ9UI33 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCN11AQ9UI33 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SCN11AQ9UI33 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SCN11AQ9UI33 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SCN11AQ9UI33 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SCN11AQ9UI33 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SCN11AQ9UI33 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SCN11AQ9UI33 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SCN11AQ9UI33 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SCN11AQ9UI33 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SCN11AQ9UI33 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SCN11AQ9UI33 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SCN11AQ9UI33 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SCN11AQ9UI33 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SCN11AQ9UI33 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SCN11AQ9UI33 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SCN11AQ9UI33 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SCN11AQ9UI33 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SCN11AQ9UI33 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SCN11AQ9UI33 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SCN11AQ9UI33 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SCN11AQ9UI33 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SCN11AQ9UI33 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SCN11AQ9UI33 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SCN11AQ9UI33 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SCN11AQ9UI33 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SCN11AQ9UI33 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SCN11AQ9UI33 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SCN11AQ9UI33 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SCN11AQ9UI33 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SCN11AQ9UI33 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SCN11AQ9UI33 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SCN11AQ9UI33 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SCN11AQ9UI33 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SCN11AQ9UI33 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SCN11AQ9UI33 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SCN11AQ9UI33 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SCN11AQ9UI33 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SCN11AQ9UI33 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SCN11AQ9UI33 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SCN11AQ9UI33 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SCN11AQ9UI33 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SCN11AQ9UI33 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SCN11AQ9UI33 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SCN11AQ9UI33 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCN11AQ9UI33 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCN11AQ9UI33 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCN11AQ9UI33 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCN11AQ9UI33 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCN11AQ9UI33 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCN11AQ9UI33 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCN11AQ9UI33 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCN11AQ9UI33 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCN11AQ9UI33 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCN11AQ9UI33 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCN11AQ9UI33 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCN11AQ9UI33 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCN11AQ9UI33 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCN11AQ9UI33 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SCN11AQ9UI33 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SCN11AQ9UI33 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SCN11AQ9UI33 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SCN11AQ9UI33 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SCN11AQ9UI33 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SCN11AQ9UI33 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SCN11AQ9UI33 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
SCN11AQ9UI33 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SCN11AQ9UI33 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SCN11AQ9UI33 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SCN11AQ9UI33 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SCN11AQ9UI33 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SCN11AQ9UI33 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SCN11AQ9UI33 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SCN11AQ9UI33 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SCN11AQ9UI33 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SCN11AQ9UI33 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SCN11AQ9UI33 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCN11AQ9UI33 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCN11AQ9UI33 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCN11AQ9UI33 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCN11AQ9UI33 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCN11AQ9UI33 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCN11AQ9UI33 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCN11AQ9UI33 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCN11AQ9UI33 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCN11AQ9UI33 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SCN11AQ9UI33 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCN11AQ9UI33 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCN11AQ9UI33 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms