Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFMBT1Q9UHJ3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFMBT1Q9UHJ3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SFMBT1Q9UHJ3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFMBT1Q9UHJ3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFMBT1Q9UHJ3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFMBT1Q9UHJ3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFMBT1Q9UHJ3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFMBT1Q9UHJ3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFMBT1Q9UHJ3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SFMBT1Q9UHJ3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SFMBT1Q9UHJ3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFMBT1Q9UHJ3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFMBT1Q9UHJ3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFMBT1Q9UHJ3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFMBT1Q9UHJ3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFMBT1Q9UHJ3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFMBT1Q9UHJ3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFMBT1Q9UHJ3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFMBT1Q9UHJ3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFMBT1Q9UHJ3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFMBT1Q9UHJ3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFMBT1Q9UHJ3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFMBT1Q9UHJ3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFMBT1Q9UHJ3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFMBT1Q9UHJ3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFMBT1Q9UHJ3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFMBT1Q9UHJ3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFMBT1Q9UHJ3 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFMBT1Q9UHJ3 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFMBT1Q9UHJ3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFMBT1Q9UHJ3 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFMBT1Q9UHJ3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFMBT1Q9UHJ3 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFMBT1Q9UHJ3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFMBT1Q9UHJ3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFMBT1Q9UHJ3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFMBT1Q9UHJ3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFMBT1Q9UHJ3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFMBT1Q9UHJ3 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFMBT1Q9UHJ3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFMBT1Q9UHJ3 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SFMBT1Q9UHJ3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFMBT1Q9UHJ3 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFMBT1Q9UHJ3 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SFMBT1Q9UHJ3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFMBT1Q9UHJ3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFMBT1Q9UHJ3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFMBT1Q9UHJ3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFMBT1Q9UHJ3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SFMBT1Q9UHJ3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SFMBT1Q9UHJ3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SFMBT1Q9UHJ3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SFMBT1Q9UHJ3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SFMBT1Q9UHJ3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SFMBT1Q9UHJ3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SFMBT1Q9UHJ3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SFMBT1Q9UHJ3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SFMBT1Q9UHJ3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SFMBT1Q9UHJ3 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SFMBT1Q9UHJ3 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SFMBT1Q9UHJ3 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SFMBT1Q9UHJ3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SFMBT1Q9UHJ3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SFMBT1Q9UHJ3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SFMBT1Q9UHJ3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SFMBT1Q9UHJ3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SFMBT1Q9UHJ3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SFMBT1Q9UHJ3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFMBT1Q9UHJ3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFMBT1Q9UHJ3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFMBT1Q9UHJ3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFMBT1Q9UHJ3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFMBT1Q9UHJ3 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFMBT1Q9UHJ3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFMBT1Q9UHJ3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFMBT1Q9UHJ3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFMBT1Q9UHJ3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFMBT1Q9UHJ3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFMBT1Q9UHJ3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFMBT1Q9UHJ3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFMBT1Q9UHJ3 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFMBT1Q9UHJ3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFMBT1Q9UHJ3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFMBT1Q9UHJ3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFMBT1Q9UHJ3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFMBT1Q9UHJ3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFMBT1Q9UHJ3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFMBT1Q9UHJ3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFMBT1Q9UHJ3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SFMBT1Q9UHJ3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SFMBT1Q9UHJ3 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SFMBT1Q9UHJ3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SFMBT1Q9UHJ3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SFMBT1Q9UHJ3 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SFMBT1Q9UHJ3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SFMBT1Q9UHJ3 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SFMBT1Q9UHJ3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms