Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH90

FBXO40, F-box only protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO40Q9UH90 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXO40Q9UH90 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXO40Q9UH90 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXO40Q9UH90 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXO40Q9UH90 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO40Q9UH90 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO40Q9UH90 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO40Q9UH90 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO40Q9UH90 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO40Q9UH90 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO40Q9UH90 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO40Q9UH90 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO40Q9UH90 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO40Q9UH90 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO40Q9UH90 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO40Q9UH90 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO40Q9UH90 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO40Q9UH90 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO40Q9UH90 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO40Q9UH90 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO40Q9UH90 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO40Q9UH90 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO40Q9UH90 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXO40Q9UH90 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXO40Q9UH90 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXO40Q9UH90 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXO40Q9UH90 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXO40Q9UH90 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXO40Q9UH90 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXO40Q9UH90 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXO40Q9UH90 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXO40Q9UH90 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXO40Q9UH90 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
FBXO40Q9UH90 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
FBXO40Q9UH90 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO40Q9UH90 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO40Q9UH90 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO40Q9UH90 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO40Q9UH90 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO40Q9UH90 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO40Q9UH90 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO40Q9UH90 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO40Q9UH90 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO40Q9UH90 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO40Q9UH90 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO40Q9UH90 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO40Q9UH90 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO40Q9UH90 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO40Q9UH90 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO40Q9UH90 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO40Q9UH90 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXO40Q9UH90 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXO40Q9UH90 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXO40Q9UH90 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXO40Q9UH90 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXO40Q9UH90 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXO40Q9UH90 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXO40Q9UH90 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXO40Q9UH90 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXO40Q9UH90 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXO40Q9UH90 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXO40Q9UH90 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXO40Q9UH90 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXO40Q9UH90 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXO40Q9UH90 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXO40Q9UH90 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXO40Q9UH90 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXO40Q9UH90 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXO40Q9UH90 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXO40Q9UH90 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXO40Q9UH90 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXO40Q9UH90 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXO40Q9UH90 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXO40Q9UH90 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXO40Q9UH90 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXO40Q9UH90 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXO40Q9UH90 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXO40Q9UH90 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXO40Q9UH90 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXO40Q9UH90 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXO40Q9UH90 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO40Q9UH90 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO40Q9UH90 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO40Q9UH90 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO40Q9UH90 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO40Q9UH90 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO40Q9UH90 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO40Q9UH90 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO40Q9UH90 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO40Q9UH90 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO40Q9UH90 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO40Q9UH90 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO40Q9UH90 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FBXO40Q9UH90 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FBXO40Q9UH90 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FBXO40Q9UH90 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FBXO40Q9UH90 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FBXO40Q9UH90 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FBXO40Q9UH90 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FBXO40Q9UH90 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms