Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCF2Q9UG63 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ABCF2Q9UG63 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ABCF2Q9UG63 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ABCF2Q9UG63 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ABCF2Q9UG63 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ABCF2Q9UG63 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ABCF2Q9UG63 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ABCF2Q9UG63 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ABCF2Q9UG63 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ABCF2Q9UG63 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ABCF2Q9UG63 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ABCF2Q9UG63 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ABCF2Q9UG63 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ABCF2Q9UG63 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ABCF2Q9UG63 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ABCF2Q9UG63 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCF2Q9UG63 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCF2Q9UG63 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCF2Q9UG63 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCF2Q9UG63 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCF2Q9UG63 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCF2Q9UG63 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCF2Q9UG63 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCF2Q9UG63 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCF2Q9UG63 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCF2Q9UG63 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCF2Q9UG63 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCF2Q9UG63 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCF2Q9UG63 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCF2Q9UG63 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCF2Q9UG63 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCF2Q9UG63 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCF2Q9UG63 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCF2Q9UG63 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCF2Q9UG63 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCF2Q9UG63 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCF2Q9UG63 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCF2Q9UG63 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCF2Q9UG63 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCF2Q9UG63 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCF2Q9UG63 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCF2Q9UG63 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCF2Q9UG63 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCF2Q9UG63 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCF2Q9UG63 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCF2Q9UG63 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCF2Q9UG63 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCF2Q9UG63 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCF2Q9UG63 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCF2Q9UG63 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCF2Q9UG63 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCF2Q9UG63 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCF2Q9UG63 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCF2Q9UG63 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCF2Q9UG63 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCF2Q9UG63 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCF2Q9UG63 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCF2Q9UG63 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCF2Q9UG63 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCF2Q9UG63 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCF2Q9UG63 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCF2Q9UG63 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCF2Q9UG63 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCF2Q9UG63 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCF2Q9UG63 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCF2Q9UG63 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCF2Q9UG63 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCF2Q9UG63 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCF2Q9UG63 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCF2Q9UG63 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCF2Q9UG63 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCF2Q9UG63 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABCF2Q9UG63 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABCF2Q9UG63 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABCF2Q9UG63 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABCF2Q9UG63 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABCF2Q9UG63 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABCF2Q9UG63 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ABCF2Q9UG63 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABCF2Q9UG63 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABCF2Q9UG63 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ABCF2Q9UG63 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABCF2Q9UG63 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABCF2Q9UG63 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCF2Q9UG63 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCF2Q9UG63 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCF2Q9UG63 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCF2Q9UG63 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCF2Q9UG63 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCF2Q9UG63 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCF2Q9UG63 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCF2Q9UG63 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCF2Q9UG63 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCF2Q9UG63 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCF2Q9UG63 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCF2Q9UG63 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCF2Q9UG63 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCF2Q9UG63 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ABCF2Q9UG63 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms