Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NIPSNAP3AQ9UFN0 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NIPSNAP3AQ9UFN0 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NIPSNAP3AQ9UFN0 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NIPSNAP3AQ9UFN0 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NIPSNAP3AQ9UFN0 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NIPSNAP3AQ9UFN0 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NIPSNAP3AQ9UFN0 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NIPSNAP3AQ9UFN0 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NIPSNAP3AQ9UFN0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NIPSNAP3AQ9UFN0 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NIPSNAP3AQ9UFN0 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NIPSNAP3AQ9UFN0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NIPSNAP3AQ9UFN0 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NIPSNAP3AQ9UFN0 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NIPSNAP3AQ9UFN0 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NIPSNAP3AQ9UFN0 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NIPSNAP3AQ9UFN0 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NIPSNAP3AQ9UFN0 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NIPSNAP3AQ9UFN0 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NIPSNAP3AQ9UFN0 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NIPSNAP3AQ9UFN0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms