Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPARGC1AQ9UBK2 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPARGC1AQ9UBK2 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPARGC1AQ9UBK2 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPARGC1AQ9UBK2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPARGC1AQ9UBK2 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPARGC1AQ9UBK2 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPARGC1AQ9UBK2 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPARGC1AQ9UBK2 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPARGC1AQ9UBK2 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPARGC1AQ9UBK2 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPARGC1AQ9UBK2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPARGC1AQ9UBK2 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPARGC1AQ9UBK2 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PPARGC1AQ9UBK2 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPARGC1AQ9UBK2 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPARGC1AQ9UBK2 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPARGC1AQ9UBK2 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPARGC1AQ9UBK2 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPARGC1AQ9UBK2 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPARGC1AQ9UBK2 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPARGC1AQ9UBK2 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PPARGC1AQ9UBK2 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPARGC1AQ9UBK2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPARGC1AQ9UBK2 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPARGC1AQ9UBK2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPARGC1AQ9UBK2 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPARGC1AQ9UBK2 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPARGC1AQ9UBK2 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPARGC1AQ9UBK2 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPARGC1AQ9UBK2 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPARGC1AQ9UBK2 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPARGC1AQ9UBK2 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPARGC1AQ9UBK2 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPARGC1AQ9UBK2 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPARGC1AQ9UBK2 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPARGC1AQ9UBK2 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPARGC1AQ9UBK2 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PPARGC1AQ9UBK2 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPARGC1AQ9UBK2 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPARGC1AQ9UBK2 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PPARGC1AQ9UBK2 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPARGC1AQ9UBK2 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPARGC1AQ9UBK2 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPARGC1AQ9UBK2 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPARGC1AQ9UBK2 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPARGC1AQ9UBK2 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPARGC1AQ9UBK2 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPARGC1AQ9UBK2 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPARGC1AQ9UBK2 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPARGC1AQ9UBK2 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPARGC1AQ9UBK2 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPARGC1AQ9UBK2 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPARGC1AQ9UBK2 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPARGC1AQ9UBK2 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPARGC1AQ9UBK2 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPARGC1AQ9UBK2 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPARGC1AQ9UBK2 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PPARGC1AQ9UBK2 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPARGC1AQ9UBK2 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPARGC1AQ9UBK2 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPARGC1AQ9UBK2 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPARGC1AQ9UBK2 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPARGC1AQ9UBK2 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPARGC1AQ9UBK2 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPARGC1AQ9UBK2 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPARGC1AQ9UBK2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPARGC1AQ9UBK2 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPARGC1AQ9UBK2 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPARGC1AQ9UBK2 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPARGC1AQ9UBK2 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPARGC1AQ9UBK2 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPARGC1AQ9UBK2 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPARGC1AQ9UBK2 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPARGC1AQ9UBK2 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPARGC1AQ9UBK2 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPARGC1AQ9UBK2 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPARGC1AQ9UBK2 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPARGC1AQ9UBK2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPARGC1AQ9UBK2 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPARGC1AQ9UBK2 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPARGC1AQ9UBK2 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPARGC1AQ9UBK2 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPARGC1AQ9UBK2 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPARGC1AQ9UBK2 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPARGC1AQ9UBK2 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPARGC1AQ9UBK2 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPARGC1AQ9UBK2 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPARGC1AQ9UBK2 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPARGC1AQ9UBK2 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPARGC1AQ9UBK2 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPARGC1AQ9UBK2 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPARGC1AQ9UBK2 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPARGC1AQ9UBK2 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPARGC1AQ9UBK2 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPARGC1AQ9UBK2 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPARGC1AQ9UBK2 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPARGC1AQ9UBK2 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPARGC1AQ9UBK2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms