Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M1

LRP2BP, LRP2-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP2BPQ9P2M1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRP2BPQ9P2M1 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRP2BPQ9P2M1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRP2BPQ9P2M1 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRP2BPQ9P2M1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRP2BPQ9P2M1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRP2BPQ9P2M1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRP2BPQ9P2M1 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRP2BPQ9P2M1 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRP2BPQ9P2M1 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRP2BPQ9P2M1 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRP2BPQ9P2M1 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRP2BPQ9P2M1 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRP2BPQ9P2M1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRP2BPQ9P2M1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRP2BPQ9P2M1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRP2BPQ9P2M1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRP2BPQ9P2M1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRP2BPQ9P2M1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRP2BPQ9P2M1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRP2BPQ9P2M1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRP2BPQ9P2M1 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRP2BPQ9P2M1 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRP2BPQ9P2M1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRP2BPQ9P2M1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRP2BPQ9P2M1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
LRP2BPQ9P2M1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRP2BPQ9P2M1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRP2BPQ9P2M1 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRP2BPQ9P2M1 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRP2BPQ9P2M1 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRP2BPQ9P2M1 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
LRP2BPQ9P2M1 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRP2BPQ9P2M1 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRP2BPQ9P2M1 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRP2BPQ9P2M1 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRP2BPQ9P2M1 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRP2BPQ9P2M1 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRP2BPQ9P2M1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRP2BPQ9P2M1 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRP2BPQ9P2M1 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRP2BPQ9P2M1 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRP2BPQ9P2M1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRP2BPQ9P2M1 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRP2BPQ9P2M1 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRP2BPQ9P2M1 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRP2BPQ9P2M1 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRP2BPQ9P2M1 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRP2BPQ9P2M1 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRP2BPQ9P2M1 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRP2BPQ9P2M1 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
LRP2BPQ9P2M1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRP2BPQ9P2M1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRP2BPQ9P2M1 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRP2BPQ9P2M1 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRP2BPQ9P2M1 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRP2BPQ9P2M1 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRP2BPQ9P2M1 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRP2BPQ9P2M1 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRP2BPQ9P2M1 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRP2BPQ9P2M1 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRP2BPQ9P2M1 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRP2BPQ9P2M1 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRP2BPQ9P2M1 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRP2BPQ9P2M1 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRP2BPQ9P2M1 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRP2BPQ9P2M1 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRP2BPQ9P2M1 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRP2BPQ9P2M1 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRP2BPQ9P2M1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRP2BPQ9P2M1 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRP2BPQ9P2M1 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRP2BPQ9P2M1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRP2BPQ9P2M1 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRP2BPQ9P2M1 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRP2BPQ9P2M1 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRP2BPQ9P2M1 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
LRP2BPQ9P2M1 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRP2BPQ9P2M1 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRP2BPQ9P2M1 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
LRP2BPQ9P2M1 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRP2BPQ9P2M1 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRP2BPQ9P2M1 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRP2BPQ9P2M1 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRP2BPQ9P2M1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRP2BPQ9P2M1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRP2BPQ9P2M1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRP2BPQ9P2M1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRP2BPQ9P2M1 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
LRP2BPQ9P2M1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRP2BPQ9P2M1 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRP2BPQ9P2M1 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRP2BPQ9P2M1 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRP2BPQ9P2M1 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRP2BPQ9P2M1 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRP2BPQ9P2M1 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRP2BPQ9P2M1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRP2BPQ9P2M1 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRP2BPQ9P2M1 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRP2BPQ9P2M1 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms