Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2D1

CHD7, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 2,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD7Q9P2D1 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHD7Q9P2D1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHD7Q9P2D1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHD7Q9P2D1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHD7Q9P2D1 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHD7Q9P2D1 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHD7Q9P2D1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHD7Q9P2D1 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHD7Q9P2D1 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHD7Q9P2D1 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHD7Q9P2D1 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHD7Q9P2D1 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHD7Q9P2D1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHD7Q9P2D1 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHD7Q9P2D1 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHD7Q9P2D1 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHD7Q9P2D1 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHD7Q9P2D1 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHD7Q9P2D1 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHD7Q9P2D1 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHD7Q9P2D1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHD7Q9P2D1 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHD7Q9P2D1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHD7Q9P2D1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHD7Q9P2D1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHD7Q9P2D1 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHD7Q9P2D1 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CHD7Q9P2D1 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CHD7Q9P2D1 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHD7Q9P2D1 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHD7Q9P2D1 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHD7Q9P2D1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CHD7Q9P2D1 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CHD7Q9P2D1 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHD7Q9P2D1 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHD7Q9P2D1 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHD7Q9P2D1 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHD7Q9P2D1 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHD7Q9P2D1 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CHD7Q9P2D1 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CHD7Q9P2D1 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHD7Q9P2D1 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHD7Q9P2D1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHD7Q9P2D1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHD7Q9P2D1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHD7Q9P2D1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CHD7Q9P2D1 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CHD7Q9P2D1 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
CHD7Q9P2D1 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CHD7Q9P2D1 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CHD7Q9P2D1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHD7Q9P2D1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHD7Q9P2D1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHD7Q9P2D1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHD7Q9P2D1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHD7Q9P2D1 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHD7Q9P2D1 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHD7Q9P2D1 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHD7Q9P2D1 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHD7Q9P2D1 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CHD7Q9P2D1 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHD7Q9P2D1 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHD7Q9P2D1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHD7Q9P2D1 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHD7Q9P2D1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHD7Q9P2D1 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHD7Q9P2D1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHD7Q9P2D1 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CHD7Q9P2D1 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHD7Q9P2D1 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHD7Q9P2D1 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHD7Q9P2D1 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHD7Q9P2D1 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHD7Q9P2D1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHD7Q9P2D1 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHD7Q9P2D1 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHD7Q9P2D1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHD7Q9P2D1 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHD7Q9P2D1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHD7Q9P2D1 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHD7Q9P2D1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHD7Q9P2D1 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHD7Q9P2D1 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CHD7Q9P2D1 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CHD7Q9P2D1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHD7Q9P2D1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHD7Q9P2D1 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CHD7Q9P2D1 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHD7Q9P2D1 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CHD7Q9P2D1 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHD7Q9P2D1 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHD7Q9P2D1 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHD7Q9P2D1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHD7Q9P2D1 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHD7Q9P2D1 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CHD7Q9P2D1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHD7Q9P2D1 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHD7Q9P2D1 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHD7Q9P2D1 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHD7Q9P2D1 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms