Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HCN3Q9P1Z3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HCN3Q9P1Z3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HCN3Q9P1Z3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
HCN3Q9P1Z3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
HCN3Q9P1Z3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
HCN3Q9P1Z3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HCN3Q9P1Z3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HCN3Q9P1Z3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HCN3Q9P1Z3 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HCN3Q9P1Z3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HCN3Q9P1Z3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HCN3Q9P1Z3 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HCN3Q9P1Z3 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HCN3Q9P1Z3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HCN3Q9P1Z3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HCN3Q9P1Z3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HCN3Q9P1Z3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HCN3Q9P1Z3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HCN3Q9P1Z3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HCN3Q9P1Z3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HCN3Q9P1Z3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HCN3Q9P1Z3 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HCN3Q9P1Z3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HCN3Q9P1Z3 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HCN3Q9P1Z3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HCN3Q9P1Z3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HCN3Q9P1Z3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HCN3Q9P1Z3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HCN3Q9P1Z3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms