Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L9

PKD2L1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2L1Q9P0L9 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PKD2L1Q9P0L9 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PKD2L1Q9P0L9 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PKD2L1Q9P0L9 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PKD2L1Q9P0L9 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PKD2L1Q9P0L9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PKD2L1Q9P0L9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PKD2L1Q9P0L9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PKD2L1Q9P0L9 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PKD2L1Q9P0L9 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PKD2L1Q9P0L9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
PKD2L1Q9P0L9 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
PKD2L1Q9P0L9 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
PKD2L1Q9P0L9 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PKD2L1Q9P0L9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PKD2L1Q9P0L9 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PKD2L1Q9P0L9 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PKD2L1Q9P0L9 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PKD2L1Q9P0L9 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PKD2L1Q9P0L9 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PKD2L1Q9P0L9 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PKD2L1Q9P0L9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PKD2L1Q9P0L9 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PKD2L1Q9P0L9 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PKD2L1Q9P0L9 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PKD2L1Q9P0L9 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PKD2L1Q9P0L9 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PKD2L1Q9P0L9 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PKD2L1Q9P0L9 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PKD2L1Q9P0L9 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PKD2L1Q9P0L9 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PKD2L1Q9P0L9 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PKD2L1Q9P0L9 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PKD2L1Q9P0L9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PKD2L1Q9P0L9 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKD2L1Q9P0L9 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKD2L1Q9P0L9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKD2L1Q9P0L9 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKD2L1Q9P0L9 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKD2L1Q9P0L9 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PKD2L1Q9P0L9 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKD2L1Q9P0L9 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKD2L1Q9P0L9 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKD2L1Q9P0L9 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKD2L1Q9P0L9 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKD2L1Q9P0L9 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKD2L1Q9P0L9 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKD2L1Q9P0L9 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKD2L1Q9P0L9 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKD2L1Q9P0L9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKD2L1Q9P0L9 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PKD2L1Q9P0L9 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKD2L1Q9P0L9 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKD2L1Q9P0L9 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKD2L1Q9P0L9 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKD2L1Q9P0L9 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKD2L1Q9P0L9 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKD2L1Q9P0L9 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKD2L1Q9P0L9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKD2L1Q9P0L9 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PKD2L1Q9P0L9 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PKD2L1Q9P0L9 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PKD2L1Q9P0L9 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PKD2L1Q9P0L9 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PKD2L1Q9P0L9 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PKD2L1Q9P0L9 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PKD2L1Q9P0L9 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PKD2L1Q9P0L9 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PKD2L1Q9P0L9 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PKD2L1Q9P0L9 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PKD2L1Q9P0L9 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PKD2L1Q9P0L9 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PKD2L1Q9P0L9 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PKD2L1Q9P0L9 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PKD2L1Q9P0L9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKD2L1Q9P0L9 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKD2L1Q9P0L9 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKD2L1Q9P0L9 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKD2L1Q9P0L9 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKD2L1Q9P0L9 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKD2L1Q9P0L9 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKD2L1Q9P0L9 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKD2L1Q9P0L9 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKD2L1Q9P0L9 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKD2L1Q9P0L9 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKD2L1Q9P0L9 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKD2L1Q9P0L9 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKD2L1Q9P0L9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKD2L1Q9P0L9 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PKD2L1Q9P0L9 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PKD2L1Q9P0L9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PKD2L1Q9P0L9 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PKD2L1Q9P0L9 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PKD2L1Q9P0L9 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PKD2L1Q9P0L9 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PKD2L1Q9P0L9 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PKD2L1Q9P0L9 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PKD2L1Q9P0L9 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PKD2L1Q9P0L9 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PKD2L1Q9P0L9 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms