Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMOD3Q9NYL9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMOD3Q9NYL9 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
TMOD3Q9NYL9 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMOD3Q9NYL9 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMOD3Q9NYL9 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMOD3Q9NYL9 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
TMOD3Q9NYL9 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMOD3Q9NYL9 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMOD3Q9NYL9 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMOD3Q9NYL9 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMOD3Q9NYL9 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMOD3Q9NYL9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMOD3Q9NYL9 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMOD3Q9NYL9 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMOD3Q9NYL9 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMOD3Q9NYL9 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMOD3Q9NYL9 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
TMOD3Q9NYL9 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMOD3Q9NYL9 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
TMOD3Q9NYL9 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMOD3Q9NYL9 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMOD3Q9NYL9 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMOD3Q9NYL9 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
TMOD3Q9NYL9 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
TMOD3Q9NYL9 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMOD3Q9NYL9 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMOD3Q9NYL9 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
TMOD3Q9NYL9 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMOD3Q9NYL9 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMOD3Q9NYL9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMOD3Q9NYL9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMOD3Q9NYL9 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMOD3Q9NYL9 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMOD3Q9NYL9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMOD3Q9NYL9 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMOD3Q9NYL9 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMOD3Q9NYL9 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMOD3Q9NYL9 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMOD3Q9NYL9 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMOD3Q9NYL9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMOD3Q9NYL9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMOD3Q9NYL9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMOD3Q9NYL9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMOD3Q9NYL9 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMOD3Q9NYL9 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TMOD3Q9NYL9 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
TMOD3Q9NYL9 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
TMOD3Q9NYL9 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
TMOD3Q9NYL9 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TMOD3Q9NYL9 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TMOD3Q9NYL9 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TMOD3Q9NYL9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TMOD3Q9NYL9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TMOD3Q9NYL9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TMOD3Q9NYL9 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMOD3Q9NYL9 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMOD3Q9NYL9 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMOD3Q9NYL9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMOD3Q9NYL9 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMOD3Q9NYL9 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMOD3Q9NYL9 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMOD3Q9NYL9 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMOD3Q9NYL9 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMOD3Q9NYL9 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
TMOD3Q9NYL9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMOD3Q9NYL9 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMOD3Q9NYL9 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMOD3Q9NYL9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMOD3Q9NYL9 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMOD3Q9NYL9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMOD3Q9NYL9 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMOD3Q9NYL9 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMOD3Q9NYL9 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMOD3Q9NYL9 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMOD3Q9NYL9 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMOD3Q9NYL9 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMOD3Q9NYL9 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
TMOD3Q9NYL9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMOD3Q9NYL9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMOD3Q9NYL9 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
TMOD3Q9NYL9 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMOD3Q9NYL9 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMOD3Q9NYL9 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMOD3Q9NYL9 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMOD3Q9NYL9 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMOD3Q9NYL9 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMOD3Q9NYL9 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMOD3Q9NYL9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMOD3Q9NYL9 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMOD3Q9NYL9 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMOD3Q9NYL9 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMOD3Q9NYL9 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMOD3Q9NYL9 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMOD3Q9NYL9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMOD3Q9NYL9 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMOD3Q9NYL9 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMOD3Q9NYL9 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMOD3Q9NYL9 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMOD3Q9NYL9 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms