Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ1

COA4, Cytochrome c oxidase assembly factor 4 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COA4Q9NYJ1 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
COA4Q9NYJ1 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
COA4Q9NYJ1 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COA4Q9NYJ1 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COA4Q9NYJ1 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COA4Q9NYJ1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COA4Q9NYJ1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COA4Q9NYJ1 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COA4Q9NYJ1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COA4Q9NYJ1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
COA4Q9NYJ1 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COA4Q9NYJ1 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COA4Q9NYJ1 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COA4Q9NYJ1 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COA4Q9NYJ1 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COA4Q9NYJ1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COA4Q9NYJ1 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COA4Q9NYJ1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COA4Q9NYJ1 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
COA4Q9NYJ1 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COA4Q9NYJ1 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COA4Q9NYJ1 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COA4Q9NYJ1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COA4Q9NYJ1 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COA4Q9NYJ1 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COA4Q9NYJ1 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COA4Q9NYJ1 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COA4Q9NYJ1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COA4Q9NYJ1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COA4Q9NYJ1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COA4Q9NYJ1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COA4Q9NYJ1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COA4Q9NYJ1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COA4Q9NYJ1 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COA4Q9NYJ1 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COA4Q9NYJ1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
COA4Q9NYJ1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
COA4Q9NYJ1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
COA4Q9NYJ1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
COA4Q9NYJ1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
COA4Q9NYJ1 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
COA4Q9NYJ1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
COA4Q9NYJ1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
COA4Q9NYJ1 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
COA4Q9NYJ1 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
COA4Q9NYJ1 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
COA4Q9NYJ1 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
COA4Q9NYJ1 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
COA4Q9NYJ1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
COA4Q9NYJ1 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
COA4Q9NYJ1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
COA4Q9NYJ1 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COA4Q9NYJ1 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COA4Q9NYJ1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COA4Q9NYJ1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COA4Q9NYJ1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COA4Q9NYJ1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COA4Q9NYJ1 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COA4Q9NYJ1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COA4Q9NYJ1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
COA4Q9NYJ1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
COA4Q9NYJ1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COA4Q9NYJ1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COA4Q9NYJ1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COA4Q9NYJ1 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COA4Q9NYJ1 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COA4Q9NYJ1 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COA4Q9NYJ1 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COA4Q9NYJ1 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COA4Q9NYJ1 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COA4Q9NYJ1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
COA4Q9NYJ1 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COA4Q9NYJ1 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COA4Q9NYJ1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
COA4Q9NYJ1 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
COA4Q9NYJ1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COA4Q9NYJ1 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
COA4Q9NYJ1 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COA4Q9NYJ1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COA4Q9NYJ1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
COA4Q9NYJ1 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COA4Q9NYJ1 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
COA4Q9NYJ1 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COA4Q9NYJ1 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
COA4Q9NYJ1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
COA4Q9NYJ1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COA4Q9NYJ1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COA4Q9NYJ1 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
COA4Q9NYJ1 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COA4Q9NYJ1 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
COA4Q9NYJ1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COA4Q9NYJ1 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COA4Q9NYJ1 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COA4Q9NYJ1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COA4Q9NYJ1 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COA4Q9NYJ1 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COA4Q9NYJ1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COA4Q9NYJ1 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COA4Q9NYJ1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COA4Q9NYJ1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms