Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
VNN3Q9NY84 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
VNN3Q9NY84 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
VNN3Q9NY84 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VNN3Q9NY84 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VNN3Q9NY84 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VNN3Q9NY84 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VNN3Q9NY84 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VNN3Q9NY84 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VNN3Q9NY84 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VNN3Q9NY84 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VNN3Q9NY84 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VNN3Q9NY84 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VNN3Q9NY84 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VNN3Q9NY84 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VNN3Q9NY84 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VNN3Q9NY84 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VNN3Q9NY84 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VNN3Q9NY84 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VNN3Q9NY84 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VNN3Q9NY84 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VNN3Q9NY84 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VNN3Q9NY84 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19■□□□□ 0.63
VNN3Q9NY84 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VNN3Q9NY84 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VNN3Q9NY84 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VNN3Q9NY84 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VNN3Q9NY84 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
VNN3Q9NY84 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VNN3Q9NY84 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VNN3Q9NY84 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VNN3Q9NY84 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VNN3Q9NY84 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC19■□□□□ 0.63
VNN3Q9NY84 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19■□□□□ 0.63
VNN3Q9NY84 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VNN3Q9NY84 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19■□□□□ 0.63
VNN3Q9NY84 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VNN3Q9NY84 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VNN3Q9NY84 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VNN3Q9NY84 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VNN3Q9NY84 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
VNN3Q9NY84 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VNN3Q9NY84 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VNN3Q9NY84 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VNN3Q9NY84 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VNN3Q9NY84 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VNN3Q9NY84 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VNN3Q9NY84 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
VNN3Q9NY84 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VNN3Q9NY84 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
VNN3Q9NY84 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VNN3Q9NY84 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VNN3Q9NY84 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VNN3Q9NY84 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VNN3Q9NY84 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VNN3Q9NY84 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VNN3Q9NY84 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VNN3Q9NY84 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VNN3Q9NY84 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VNN3Q9NY84 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VNN3Q9NY84 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VNN3Q9NY84 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VNN3Q9NY84 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VNN3Q9NY84 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VNN3Q9NY84 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VNN3Q9NY84 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
VNN3Q9NY84 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VNN3Q9NY84 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VNN3Q9NY84 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VNN3Q9NY84 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VNN3Q9NY84 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VNN3Q9NY84 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VNN3Q9NY84 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms