Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXZ2

DDX43, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX43Q9NXZ2 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDX43Q9NXZ2 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDX43Q9NXZ2 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDX43Q9NXZ2 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDX43Q9NXZ2 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDX43Q9NXZ2 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDX43Q9NXZ2 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDX43Q9NXZ2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDX43Q9NXZ2 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDX43Q9NXZ2 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDX43Q9NXZ2 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDX43Q9NXZ2 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDX43Q9NXZ2 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDX43Q9NXZ2 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
DDX43Q9NXZ2 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDX43Q9NXZ2 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDX43Q9NXZ2 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDX43Q9NXZ2 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDX43Q9NXZ2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDX43Q9NXZ2 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDX43Q9NXZ2 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDX43Q9NXZ2 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDX43Q9NXZ2 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDX43Q9NXZ2 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDX43Q9NXZ2 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
DDX43Q9NXZ2 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDX43Q9NXZ2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDX43Q9NXZ2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDX43Q9NXZ2 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDX43Q9NXZ2 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDX43Q9NXZ2 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDX43Q9NXZ2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDX43Q9NXZ2 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDX43Q9NXZ2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDX43Q9NXZ2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDX43Q9NXZ2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DDX43Q9NXZ2 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DDX43Q9NXZ2 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
DDX43Q9NXZ2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DDX43Q9NXZ2 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DDX43Q9NXZ2 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DDX43Q9NXZ2 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DDX43Q9NXZ2 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DDX43Q9NXZ2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DDX43Q9NXZ2 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DDX43Q9NXZ2 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DDX43Q9NXZ2 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DDX43Q9NXZ2 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DDX43Q9NXZ2 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DDX43Q9NXZ2 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DDX43Q9NXZ2 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DDX43Q9NXZ2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DDX43Q9NXZ2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DDX43Q9NXZ2 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
DDX43Q9NXZ2 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DDX43Q9NXZ2 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DDX43Q9NXZ2 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DDX43Q9NXZ2 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DDX43Q9NXZ2 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DDX43Q9NXZ2 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DDX43Q9NXZ2 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DDX43Q9NXZ2 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
DDX43Q9NXZ2 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DDX43Q9NXZ2 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DDX43Q9NXZ2 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DDX43Q9NXZ2 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DDX43Q9NXZ2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DDX43Q9NXZ2 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
DDX43Q9NXZ2 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DDX43Q9NXZ2 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DDX43Q9NXZ2 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DDX43Q9NXZ2 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DDX43Q9NXZ2 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DDX43Q9NXZ2 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DDX43Q9NXZ2 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DDX43Q9NXZ2 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DDX43Q9NXZ2 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DDX43Q9NXZ2 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DDX43Q9NXZ2 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DDX43Q9NXZ2 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DDX43Q9NXZ2 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DDX43Q9NXZ2 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DDX43Q9NXZ2 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DDX43Q9NXZ2 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DDX43Q9NXZ2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DDX43Q9NXZ2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DDX43Q9NXZ2 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DDX43Q9NXZ2 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DDX43Q9NXZ2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DDX43Q9NXZ2 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
DDX43Q9NXZ2 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
DDX43Q9NXZ2 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
DDX43Q9NXZ2 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DDX43Q9NXZ2 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
DDX43Q9NXZ2 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DDX43Q9NXZ2 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DDX43Q9NXZ2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DDX43Q9NXZ2 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DDX43Q9NXZ2 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
DDX43Q9NXZ2 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
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